The invention discloses a primer composition for rapid detection of Alternaria LAMP and its application. The primer composition of the invention is composed of the following primers: F3, B3, BIP and FIP. The primer composition is used for rapid detection of LAMP of sporospora. Therefore, the primer composition described in the present invention can be used in detection and / or identification of cyclosporin. It provides a simple, fast, low cost detection technique for scientific research and production practice, and also for the spores of chain spores. Early warning and rational drug use provide theoretical basis and technical guidance, and have realistic and far-reaching significance for increasing ecological, social and economic benefits.
【技术实现步骤摘要】
一种用于链格孢菌LAMP快速检测的引物组合物及其应用
本专利技术涉及农作物病害检测鉴定技术和分子生物学
,具体涉及一种用于链格孢菌LAMP快速检测的引物组合物及其应用。
技术介绍
链格孢菌(Alternariasp.)是全球分布最广,经济上重要的半知菌类真菌之一。95%以上的种类兼性寄生于植物上,引起多种植物病害,造成全球性的田间和产后巨大的经济损失。有几个链格孢小孢子种可侵染人和动物,引起皮癣、甲癣、颚骨髓炎等疾病。链格孢产生的某些真菌毒素是重要的致癌因素。另一方面,链格孢菌也是有应用潜力的生物资源,某些链格孢种高产纤维素酶或可开发为生防制剂,作为植物内生菌的一些链格孢可产生长春碱、紫杉醇等抗癌药物。近年来随着分子生物学相关技术的发展,基于PCR的方法已经成功用于检测链格孢菌,尽管以PCR为基础的分子鉴定方法一定程度上克服了传统形态鉴定上的缺陷,但由于检测需要PCR仪、凝胶电泳和成像系统仪等昂贵的专业仪器设备,同时需要操作人员具有一定的分子生物学专业技能,并且只能在实验室条件下完成,需要较长的时间,检测过程复杂,不能满足快速检测的需求,限制了PCR检测方法在生产中的推广应用。环介导等温扩增技术(Loop‐mediatedisothermalamplification,LAMP)是Notomi等开发的一种恒温扩增方法,该方法针对靶基因的6个位点设计出4条引物,利用一种具有链式置换活性的DNA聚合酶(BstDNApolymerase),在恒温条件下(60℃左右)保温30‐90分钟,即可完成扩增反应。由于该反应过程中产生焦磷酸镁沉淀物,出现浑浊沉淀,因此 ...
【技术保护点】
1.一种用于链格孢菌LAMP快速检测的引物组合物,其特征在于:该引物组合物包括一对外引物F3、B3和一对内引物FIP、BIP,所述引物序列为:F3:5’‑GGCTCCTTTGAATGGTAAC‑3’;B3:5’‑TGTCTTCAACCAAGCATCA‑3’;FIP:5’‑CGCTGCAAGTAATCTATAAATCGGATTCAATAGGCAAATGGGGA‑3’;BIP:5’‑AATGGATCAAGAACGTTCAACGAATTGGTTGTGGGGTACTC‑3’。
【技术特征摘要】
1.一种用于链格孢菌LAMP快速检测的引物组合物,其特征在于:该引物组合物包括一对外引物F3、B3和一对内引物FIP、BIP,所述引物序列为:F3:5’-GGCTCCTTTGAATGGTAAC-3’;B3:5’-TGTCTTCAACCAAGCATCA-3’;FIP:5’-CGCTGCAAGTAATCTATAAATCGGATTCAATAGGCAAATGGGGA-3’;BIP:5’-AATGGATCAAGAACGTTCAACGAATTGGTTGTGGGGTACTC-3’。2.权利要求1所述的LAMP引物组合物在制备链格孢菌检测试剂中的应用。3.权利要求1所述的LAMP引物组合物在检测和/或鉴定链格孢菌中的应用。4.一种用于检测链格孢菌的试剂,其特征在于包含权利要求1所述的引物组合物。5.一种链格孢菌LAMP快速检测方法,其特征在于包括以下步骤:...
【专利技术属性】
技术研发人员:杨雪,陈雨,谷春艳,臧昊昱,
申请(专利权)人:安徽省农业科学院植物保护与农产品质量安全研究所,
类型:发明
国别省市:安徽,34
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