C/EBPαSARNA组合物和使用方法技术

技术编号:18464286 阅读:19 留言:0更新日期:2018-07-18 15:08
本发明专利技术涉及靶向C/EBPα转录物的saRNA和包含所述saRNA的治疗性组合物。还提供使用治疗性组合物的方法。

C/EBP alpha SARNA composition and use method

The invention relates to saRNA targeting C/EBP alpha transcripts and a therapeutic composition comprising the saRNA. A method of using a therapeutic composition is also provided.

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】C/EBPαSARNA组合物和使用方法相关申请的交叉引用本申请要求2015年4月22日提交的美国临时申请号62/150,889、2015年10月1日提交的美国临时申请号62/235,778和2016年3月15日提交的美国临时申请号62/308,521的优先权,所述每篇文献的内容通过引用的方式完整并入本文。序列表的引用本申请随电子格式的序列表一起提交。电子格式的序列表中的信息通过引用的方式完整并入本文。
本专利技术涉及用于调节C/EBPα和C/EBPα途径的多核苷酸(尤其saRNA)、组合物,并且涉及在治疗性应用如治疗代谢疾病、过度增生性疾病和调节干细胞系中使用该组合物的方法。专利技术背景CCAAT/增强子结合蛋白α(C/EBPα、C/EBPα、C/EBPA或CEBPA)是一种在人类和大鼠之间保守的亮氨酸拉链蛋白。这种核转录因子富含于肝细胞、骨髓单核细胞、脂肪细胞以及其他类型的乳腺上皮细胞中[Lekstrom-Himes等人,J.Bio.Chem,vol.273,28545-28548(1998)]。它由N端部分中的两个反式激活结构域和介导与其他C/EBP家族成员二聚化的亮氨酸拉链区域和在C端部分的DNA结合结构域组成。C/EBP转录因子家族的结合位点存在于参与维持正常肝细胞功能和损伤反应的多种基因的启动子区中。C/EBPα对参与免疫反应和炎症反应、发育、细胞增殖、抗凋亡和几条代谢途径的几种肝特异性基因的转录具有多效性影响[Darlington等人,CurrentOpinionofGeneticDevelopment,vol.5(5),565-570(1995)]。它对维持肝细胞分化状态至关重要。它激活白蛋白转录并协调编码多种参与脲产生的鸟氨酸循环酶的基因的表达,因此在正常肝功能中发挥重要作用。在成年肝脏中,C/EBPα定义为在终末分化的肝细胞中发挥作用,而快速增殖的肝瘤细胞仅表达C/EBPα的一部分[Umek等人,Science,vol.251,288-292(1991)]。已知C/EBPα通过上调视网膜母细胞瘤并抑制Cdk2和Cdk4,而上调细胞增殖强力抑制剂p21[Timchenko等人,Genes&Development,vol.10,804-815(1996);Wang等人,MolecularCell,vol.8,817-828(2001)]。在肝细胞癌(HCC)中,C/EBPα作为具有抗增殖性特性的肿瘤抑制物发挥作用[Iakova等人,SeminarsinCancerBiology,vol.21(1),28-34(2011)]。实施了不同方法以研究C/EBPαmRNA或蛋白的调节作用。已知C/EBPα蛋白通过翻译后磷酸化和SUMO化而受到调节。例如,FLT3酪氨酸激酶抑制剂和胞外信号调节的激酶1和/或2(ERK1/2)阻断C/EBPα的丝氨酸-21磷酸化,这增加了C/EBPα蛋白的粒细胞分化潜能[Radomska等人,JournalofExperimentalMedicine,vol.203(2),371-381(2006)和Ross等人,MolecularandCellularBiology,vol.24(2),675-686(2004)]。此外,C/EBPα翻译可以由2-氰基-3,12-二氧齐墩果烷-1,9-二烯-28-酸(CDDO)高效诱导,这改变了C/EBPα蛋白同工型的比率,对全长p42形式有利性超过p30形式,从而诱导粒细胞分化[Koschmieder等人,Blood,vol.110(10),3695-3705(2007)]。C/EBPα基因是位于染色体19q13.1上的无内含子基因。大部分真核细胞使用RNA-互补性作为调节基因表达的机制。一个例子是使用双链短干扰性RNA借助RNA诱导性沉默复合体(RISC)敲减基因表达的RNA干扰(RNAi)途径。现已确立,短双链体RNA寡核苷酸还具有靶向基因的启动子区并介导这些基因的转录激活的能力,并且已经将它们称作RNA活化(RNAa)、抗基因RNA(agRNA)或短活化性RNA(saRNA)[Li等人,PNAS,vol.103,17337-17342(2006)]。saRNA诱导的基因激活在其他哺乳动物物种(包括小鼠、大鼠和非人灵长类)中保守并且正迅速成为一种研究基因内源上调的影响的流行方法。因此,需要用saRNA出于治疗目的定向调节C/EBPα。专利技术概述本专利技术提供了设计、制备、制造、配制和/或使用出于治疗目的(包括诊断和预后)而调节C/EBPα基因表达和/或功能的短活化性RNA(saRNA)分子的组合物、方法和试剂盒。本专利技术的一个方面提供一种包含靶向C/EBPα转录物的saRNA和至少一种可药用载体的药物组合物。本专利技术的又一个方面提供一种调节干细胞分化和多能性的方法,所述方法包括使所述干细胞与靶向C/EBPα转录物的saRNA接触。在下文描述中叙述了本专利技术的多种实施方案的详细内容。本专利技术的其他特征、目的和优点将从本描述及附图并且从权利要求书中显而易见。附图简述前述目的和其他目的、特征和优点将从以下对如附图中所示的本专利技术具体实施方案的描述显而易见,其中相同参考字符在不同视图间始终指相同的部分。附图不必然符合比例,反而重点在于说明本专利技术各种实施方案的原理。图1显示C/EBPα对肝脏的主要影响。图2显示C/EBPα对脂肪组织的次要影响。图3是说明参与本专利技术saRNA的功能的各核酸部分之间关系的示意图。图4A-4D显示CEBPA-saRNA上调一组HCC细胞中的CEBPA。图5A-5D显示CEBPA-saRNA上调一组HCC细胞中的白蛋白。图6A显示用修饰的saRNA转染的DU145细胞中对GAPDH归一化的CEBPAmRNA水平。图6B显示DU145细胞中的GAPDHmRNA水平。图6C显示作为转染对照的Aha1mRNA水平。图7A-7B显示用CEBPA-siRNA或Fluc转染的DU145细胞中对GAPDH归一化的CEBPAmRNA水平。图7C显示用AhA-1-siRNA转染的DU145细胞中对GAPDH归一化的AhA-1mRNA水平。图8A-8C显示用三种saRNA转染的DU145细胞中对GAPDH归一化的CEBPAmRNA水平。图9包含显示表达水平的图9A和图9B。图9A显示非增殖培养基中肝细胞的AhA1、白蛋白和CEBPA相对表达水平。图9B显示增殖培养基中肝细胞的AhA1、白蛋白和CEBPA相对表达水平。图10A显示代表性蛋白质印迹,其显示CEBPA-51转染后HepG2、Hep3B和PLCPRF5细胞中C/EBP-α蛋白水平。图10B显示HepG2、Hep3B和PLCPRF5细胞中经CEBPA-51转染后的相对CEBPAmRNA表达(***p=0.0002;**p=0.0012)。图11A-11C显示HEP3B、HEPG2和PLCPRF5细胞系中AW51的WST-1细胞增殖分析结果。图11D-11F显示HEP3B、HEPG2和PLCPRF5细胞系中AW51的磺酰罗丹明B(SRB)细胞数目分析结果。图12A-12B显示在HuH7细胞(图12A)和Panc-1细胞(图12B)中测量的AW51脱靶。图13A-13B本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.上调C/EBPα基因表达的分离的合成性saRNA,其中saRNA至少80%互补于SEQ ID No.77上的区域,并且其中saRNA具有14‑30个核苷酸。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.04.22 US 62/150,889;2015.10.01 US 62/235,778;1.上调C/EBPα基因表达的分离的合成性saRNA,其中saRNA至少80%互补于SEQIDNo.77上的区域,并且其中saRNA具有14-30个核苷酸。2.根据权利要求1所述的saRNA,其中saRNA为单链。3.根据权利要求2所述的saRNA,其中saRNA包含3’突出端。4.根据权利要求2所述的saRNA,其中saRNA是经修饰的。5.根据权利要求4所述的saRNA,其中saRNA包含至少2个修饰。6.根据权利要求4所述的saRNA,其中所述修饰包括2’-F、2’-OMe、反转脱氧核糖或核苷酸间硫代磷酸酯键的任一种。7.根据权利要求2所述的saRNA,其中所述saRNA包含选自SEQIDNo.35、37、39、41、43、45、47、49、93(AW51)和109(CEBPA51)的序列。8.根据权利要求1所述的saRNA,其中所述saRNA为双链并且包含反义链和有义链。9.根据权利要求5所述的saRNA,其中所述反义链包含选自SEQIDNo.35、37、39、41、43、45、47、49、93(AW51)和109(CEBPA51)的序列。10.根据权利要求6所述的saRNA,其中所述有义链包含选自SEQIDNo.34、36、38、40、42、44、48、94和110的序列。11.根据权利要求8所述的saRNA,其中所述saRNA是经修饰的。12.根据权利要求11所述的saRNA,其中所述saRNA包含至少2个修饰。13.根据权利要求11所述的saRNA,其中所述修饰可以包括2’-F、2’-OMe、反转脱氧核糖或核苷酸间硫代磷酸酯键的任一种。14.根据权利要求11所述的saRNA,其中所述修饰在有义链上。15.根据权利要求11所述的saRNA,其中所述修饰在有义链和反义链两者上。16.根据权利要求1所述的saRNA,其中所述saRNA是缀合的。17.根据权利要求16所述的saRNA,其中所述saRNA与糖配体缀合。18.上调细胞中C/EBPα基因的方法,包括向所述细胞施用权利要求1-15中任一项所述的saRNA。19.根据权利要求18所述的方法,其中所述细胞是正在增殖的细胞。20.根据权利要求19所述的方法,其中所述细胞是癌细胞。21.根据权利要求20所述的方法,其中所述细胞是肝细胞癌(HCC)细胞。22.根据权利要求18所述的方法,其中C/EBPαmRNA上调的EC50高于1.0。23.根据权利要求18所述的方法,其中C/EBPα基因上调至少20%。24.根据权利要求22所述的方法,其中C/EBPα基因上调至少2倍。25.上调细胞中的基因表达的方法,所述基因选自丙氨酸-乙醛酸氨基转移酶(AGXT)、细胞色素P4503A4(CYP3A4)、鸟氨酸氨甲酰基转移酶(OTC)或肝细胞核因子4-α(HNF4a),所述方法包括施用上调C/EBPα基因表达的分离的合成性saRNA或其药物组合物,其中所述saRNA至少80%互补于SEQIDNo.77上的区域,并且其中所述saRNA具有14-30个核苷酸。26.根据权利要求25所述的方法,其中所述细胞是正在过度增殖的细胞。27.根据权利要求26所述的方法,其中所述细胞是癌细胞。28.根据权利要求27所述的方法,其中所述细胞是肝细胞癌(HCC)细胞。29.根据权利要求25所述的方法,其中所述细胞不是正在过度增殖的细胞。30.根据权利要求29所述的方法,其中所述细胞是人原代肝细胞。31.根据权利要求25所述的方法,其中从C/EBPα基因的编码链转录的反义RNA转录物未被切割。32.根据权利要求25所述的方法,其中所述saRNA与Ago2蛋白结合。33.根据权利要求25所述的方法,其中所述基因表达上调至少20%。34.根据权利要求26所述的方法,其中所述基因表达上调至少2倍。35.治疗有需求的受试者的肝纤维化、肝衰竭或非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的方法,包括施用上调C/EBPα基因表达的分离的合成性saRNA或其药物组合物,其中所述saRNA至少80%互补于SEQIDNo.77上的区域,并且其中所述saRNA具有14-30个核苷酸。36.根据权利要求35所述的方法,其中所述肝衰竭是急性肝衰竭。37.根据权利要求35所述的方法,其中所述受试者的总胆红素(TBIL)水平、循环丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平、天冬氨酸氨基转移酶(AST)水平,碱性磷酸酶(ALP)水平、γ-谷氨酰基-转肽酶(GGT)水平、肝羟脯氨酸水平、凝血酶原时间、氨或肝甘油三酯(肝TG)的水平降低。38.根据权利要求35所述的方法,其中所述受试者的血清白蛋白水平、总蛋白水平增加。39.根据权利要求35所述的方法,其中所述受试者的纤维组织或假小叶形成减少。40.治疗有需求的受试者的II型糖尿病或胰岛素抵抗的方法,包括施用上调C/EBPα基因表达的分离的合成性saRNA或其药物组合物,其中所述saRNA至少80%互补于SEQIDNo.77上的区域,并且其中所述saRNA具有14-30个核苷酸。41.根据权利要求40所述的方法,其中所述受试者的肝脏胆固醇水平、血清AST水平、空腹葡萄糖水平、甘油三酯与HDL-C的比率或肝与身体的比率降低。42.根据权利要求40所述的方法,其中所述受试者的胰岛素水平升高。43.根据权利要求25、35或40所述的方法,其中所述saRNA为双链并且包含反义链和有义链。44.根据权利要求43所述的方法,其中所述saRNA的反义链和/或有义链包含3’突出端。45.根据权利要求43所述的saRNA,其中所述saRNA是经修饰的。46.根据权利要求45所述的saRNA,其中所述saRNA包含至少2个修饰。47.根据权利要求45所述的saRNA,其中所述修饰可以包括2’-F、2’-OMe、反转脱氧核糖或核苷酸间硫代磷酸酯键的任一种。48.根据权利要求45所述的saRNA,其中所述修饰在有义链上。49.根据权利要求45所述的saRNA,其中所述修饰在有义链和反义链两者上。50.根据权利要求43所述的方法,其中所述反义链包含选自SEQIDNo.2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、35、37、39、41、43、45、47、49、93(AW51)和109(CEBPA51)的序列。51.根据权利要求50所述的方法,其中所述有义链包含选自SEQIDNo.1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、2...

【专利技术属性】
技术研发人员:A·瓦格纳R·哈比卜H·E·胡贝尔P·萨特罗姆E·B·斯图夫纳M·霍斯巴赫M·卡兰波特HP·沃尔洛赫尔
申请(专利权)人:米纳治疗有限公司
类型:发明
国别省市:英国,GB

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