多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法技术

本发明专利技术提供了一种多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，包括先获取待检测基因数据，再从待检测基因数据中获取待检测基因样本数据；并对待检测基因样本数据进行多种多个基因联合检测，分别获取各联合检测的阳性检出率；对各联合检测的阳性检出率χ2检验获取P值，若P值大于设定P值比例则当前多个基因联合检测为最优多个基因联合检测方式；最后通过最优多个基因联合检测方式对待检测基因数据进行检测获取当前检测数据。本发明专利技术的此种联合检测方式的检测结果更加精确，阳性检出率和特异性高，并且成本低，可用于筛查早期CRC的临床敏感性及特异性。

Accurate treatment of fecal DNA methylation data based on multi gene combination

The present invention provides an accurate method for processing data of detection of DNA methylation of multiple genes, including obtaining the data to be detected first, and obtaining the data of the samples to be detected from the detected gene data. The positive detection rate of the test was detected. The P value was obtained by the chi 2 test of the positive detection rate of the combined tests. If the P value was larger than the set P value, multiple genes were combined to detect the optimal multiple gene joint detection methods. Finally, the detection data were detected by the optimal multiple gene joint detection methods. The detection result of the combined detection method of the invention is more accurate, the positive detection rate and specificity are high, and the cost is low, and it can be used to screen the clinical sensitivity and specificity of early CRC.

【技术实现步骤摘要】
多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法
本专利技术涉及医学
，尤其涉及一种多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法。
技术介绍
结肠直肠癌(Colorectalcancer，CRC)是最为常见的消化道恶性肿瘤，近几年随着生活水平的不断提高，CRC的发病率逐年攀升，但多数病例多在中晚期阶段才被诊断，预后不佳，死亡率高。其早期症状不典型，若早期发现可明显改善预后，提高患者生存期，降低死亡率。目前临床上常用筛查结肠直肠癌的方法主要包括电子结直肠镜检测和大便潜血试验(fecaloccultbloodtest，FOBT)，分别因其是侵入性检查或阳性检出率低等缺点而限制了在CRC筛查上的广泛应用。近年来，DNA甲基化已被公认为是表观遗传学导致癌症特别是CRC演变的重要因素，多项指南已明确指出甲基化检测可作为早期CRC筛查的方法。同时因其属于非侵入性检查，患者接受度与依从性均明显高于结肠镜检查。血浆Septin9甲基化试剂盒已广泛用于临床，其对CRC的检出率和特异性均明显优于FOBT检测，但其检测成本较高，患者往往难以接受。由于肿瘤细胞可从肠粘膜表面持续脱落并随粪便排出体外，因此粪便样本也可用于DNA甲基化筛查。大量数据表明，粪便DNA甲基化检测的阳性检出率和特异性明显超出血液标本。然而，单基因粪便DNA甲基化检测诊断CRC的检出率和特异性较低，虽然多基因联合进行甲基化检测能提高检出率，但随着联合检测基因个数的增多，成本也会升高，高成本的检测方法显然不适用于大范围CRC早期筛查工作，因此寻找具有高阳性检出率和特异性的同时，还能降低检测成本的最适基因组合，对于CRC筛查意义重大。
技术实现思路
针对现有技术的上述缺陷和问题，本专利技术实施例的目的是提供一种多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，本专利技术的处理方法能够提供一种具有阳性检出率最高、特异性最灵敏及检测成本最低的CRC基因筛查组合。为了达到上述目的，本专利技术提供如下技术方案：多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，包括以下步骤：获取待检测基因数据，从所述待检测基因数据中获取待检测基因样本数据；对所述待检测基因样本数据进行多种多个基因联合检测，分别获取各联合检测的阳性检出率；对所述各联合检测的阳性检出率χ2检验获取P值，若所述P值大于设定P值比例则当前多个基因联合检测为最优多个基因联合检测方式；通过所述最优多个基因联合检测方式对所述待检测基因数据进行检测获取当前检测数据。进一步地，所述多种多个基因联合检测项目为：CNRIP1/SNCA、CNRIP1/SFRP2、CNRIP1/Vimentin、SNCA/SFRP2、SNCA/Vimentin、SFRP2/Vimentin、CNRIP1/SNCA/SFRP2、CNRIP1/SNCA/Vimentin、CNRIP1/SFRP2/Vimentin、SNCA/SFRP2/Vimentin、CNRIP1/SNCA/SFRP2/Vimentin。进一步地，所述设定P值比例为0.05。进一步地，本专利技术的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法还包括：接收待检测基因样本数据。进一步地，本专利技术的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法还包括：对当前检测数据进行显示。本专利技术提供的一种多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，其有益效果在于：通过本专利技术的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，将经典的Vimentin和SFRP2基因和新近发现的CNRIP1和SNCA基因联合进行甲基化检测，以寻找最佳组合筛查CRC。在多种多个基因联合检测中，择优获取最优的多个基因联合检测方式，并通过此最优的多个基因联合检测方式获取当前的检测数据。此种联合检测方式的检测结果更加精确，阳性检出率和特异性高，可用于筛查早期CRC的临床敏感性及特异性。另外，通过对多种多个基因联合检测方式进行筛选，临床标本验证提示其中的SNCA/SFRP2/Vimentin基因的临床敏感性及特异性为88.2％、84.1％；与CRC商品化试剂盒的检测结果比较无明显差异，且费用较CRC商品化试剂盒相对低廉，操作流程也相对简单。多基因粪便DNA甲基化联合检测可明显提高筛查早期CRC的临床敏感性及特异性，较FOBT、电子结直肠镜、血液甲基化检测试剂盒等检测方法，具有非侵入性、无创伤、操作简便、成本较低、阳性检出率和特异性较高等优点，有望用于临床的大规模CRC的筛查。附图说明为了更清楚地说明本专利技术实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本专利技术的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动性的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。图1是本专利技术的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法连接示意图。具体实施方式下面将结合本专利技术的实施例，对本专利技术的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本专利技术一部分实施例，而不是全部的实施例。基于本专利技术中的实施例，本领域普通技术人员在没有作出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都属于本专利技术保护的范围。根据图1所示。本专利技术的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，包括以下步骤：首先获取待检测基因数据S100，从上述待检测基因数据中接收并显示待检测基因样本数据，获取待检测基因样本数据S101后对上述待检测基因样本数据进行多种多个基因联合检测S102，分别获取各联合检测的阳性检出率χ2S103；本专利技术优选的上述多种多个基因联合检测项目为：CNRIP1/SNCA、CNRIP1/SFRP2、CNRIP1/Vimentin、SNCA/SFRP2、SNCA/Vimentin、SFRP2/Vimentin、CNRIP1/SNCA/SFRP2、CNRIP1/SNCA/Vimentin、CNRIP1/SFRP2/Vimentin、SNCA/SFRP2/Vimentin、CNRIP1/SNCA/SFRP2/Vimentin。其中，两个基因联合检测时，CNRIP1/SNCA联合检测CRC的阳性检出率为85.0％，CNRIP1/SFRP2联合检测CRC的阳性检出率为91.7％，CNRIP1/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为93.3％，SNCA/SFRP2联合检测CRC的阳性检出率为83.3％，SNCA/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为91.7％，SFRP2/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为91.7％，特异性分别为88.0％、84.0％、92.0％、84.0％、92.0％、88.0％。三个基因联合检测时，CNRIP1/SNCA/SFRP2联合检测CRC的阳性检出率为93.3％，CNRIP1/SNCA/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为96.7％，SNCA/SFRP2/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为96.7％，CNRIP1/SFRP2/Vimentin联合检测CRC的阳性检出率为98.3％，特异性分别为88.0％、80.0％、84.0％、80.0％。四个基因联合检测时，CNRIP1/SNCA/SFR本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，包括以下步骤：获取待检测基因数据，从所述待检测基因数据中获取待检测基因样本数据；对所述待检测基因样本数据进行多种多个基因联合检测，分别获取各联合检测的阳性检出率；对所述各联合检测的阳性检出率χ2检验获取P值，若所述P值大于设定P值比例则当前多个基因联合检测为最优多个基因联合检测方式；通过所述最优多个基因联合检测方式对所述待检测基因数据进行检测获取当前检测数据。

【技术特征摘要】
1.多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，包括以下步骤：获取待检测基因数据，从所述待检测基因数据中获取待检测基因样本数据；对所述待检测基因样本数据进行多种多个基因联合检测，分别获取各联合检测的阳性检出率；对所述各联合检测的阳性检出率χ2检验获取P值，若所述P值大于设定P值比例则当前多个基因联合检测为最优多个基因联合检测方式；通过所述最优多个基因联合检测方式对所述待检测基因数据进行检测获取当前检测数据。2.根据权利要求1所述的多基因联合的粪便DNA甲基化检测数据的精确处理方法，其特征在于，所述多种多个基因联合检测项目为：CNRIP1/SNCA、CNRIP1/SFRP2、CNRIP1/Vimentin、SNCA/SFRP2...

【专利技术属性】
技术研发人员：张明鑫，王景杰，崔曼莉，周苏娜，叶文广，窦准佳，秦小金，姚青林，秦明，
申请(专利权)人：张明鑫，
类型：发明
国别省市：陕西,61