The present invention discloses a porcine mitochondrial genome target sequence capture kit and its application. The kit includes the capture probe that targets the genome sequence of the pig mitochondria. The capture probe is composed of the nucleotide sequence marked by biotin. The nucleotide sequence, such as SEQ ID NO:1 106, obtains the pig mitochondrial genome. The method of sequence includes the following steps: 1) extraction of pig genome DNA; 2) construction of the whole genome library of pigs; 3) the genome sequence of pig mitochondrial genome can be obtained by hybridization, sequencing and sequence splicing of the capture probe. This method is especially suitable for the target capture pig ancient DNA grain genome sequence, and its sensitivity is high. It has strong specificity, good stability and high capture efficiency with a nucleic acid library. The coverage can reach 99.99% and the detection cost is low.
【技术实现步骤摘要】
一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒及其应用
本专利技术属于生物
,具体涉及一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒,还涉及一种获取猪线粒体基因组序列的新方法,以及该捕获试剂盒在获取猪古DNA线粒体基因组序列中的应用。
技术介绍
一般说来,人类历史上的农业革命主要包括栽培作物的产生和驯化动物的起源。系统性探索家畜的起源,对于了解家畜的发展史、揭示家畜对人类生活方式的影响至关重要。众所周知,家猪(Susscrofa)缘自野猪的驯化。目前,野猪分布区域集中在:1)欧亚大陆的南部,即分布于欧洲、北非和亚洲中部天山山脉的欧洲野猪;2)亚洲,即分布于中国大陆、台湾、爪哇、苏门答腊和新几内亚的亚洲野猪(胡耀武和王昌燧,2004年,家猪起源的研究现状与思考)。相比之下,家猪的分布范围要大得多,几乎遍及全世界,其品种也千差万别、多种多样。家猪与野猪在形态和习性上的差别明显,这引发了我们的思考:性情凶猛的野猪是如何驯化为形态、习性迥然不同的家猪呢?家猪起源于何时、何地?系单一起源,抑或多个起源呢?诸如此类,皆为学术界长期关注的问题。多年来,国内外学者从不同角度,孜孜以求地探索家猪的起源与驯化,业已取得颇为丰硕的成果,然而,诸如驯化之初,鉴别家猪和野猪等关键问题,至今仍茫然无绪。自考古学诞生以来,发掘成果日新月异、层出不穷,为探索家猪起源提供了颇为翔实的实物资料。猪的驯化是中国古代最伟大的创造专利技术之一。有报道指出,经过5年田野考察与研究,湖北省文物考古研究所罗运兵博士将中国家猪的起源时间,前推至距今9000年左右。其撰写的《中国古代猪类驯化、饲养与仪式性使用》一书,立足 ...
【技术保护点】
1.一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒,其特征在于,包括猪线粒体基因组序列的捕获探针,所述的捕获探针由生物素标记的核苷酸序列组成,核苷酸序列如SEQ ID NO:1‑106所示。
【技术特征摘要】
1.一种猪线粒体基因组靶向序列捕获试剂盒,其特征在于,包括猪线粒体基因组序列的捕获探针,所述的捕获探针由生物素标记的核苷酸序列组成,核苷酸序列如SEQIDNO:1-106所示。2.一种靶向捕获猪线粒体基因组序列的新方法,包括以下步骤:1)提取猪的基因组DNA;2)构建猪的全基因组文库:A.末端补平;B.接头连接:将SOLiD接头15′-TGTAACATCACAGCATCACCGCCATCAGTCT-3′和接头25′-GACTGATGGCGCACTACGACACTACAATGT-3′与末端补平的DNA连接;C.回收纯化含SOLiD接头的DNA;D.采用切口平移法进行文库模板量的平衡线性扩增,正向引物:5′-TGTAACATCACAGCATCACCGCCATCAGTCT-3′和反向引物5′-GACTGATGGCGCACTACGACACTACAATGT-...
【专利技术属性】
技术研发人员:赵书红,谢胜松,倪攀,陈俭海,李世军,韩晓松,刘向东,杜小勇,马云龙,赵长志,
申请(专利权)人:华中农业大学,
类型:发明
国别省市:湖北,42
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