用于确定患有I期和II期透明细胞型肾癌瘤的肾癌患者的复发风险的预后方法以及其试剂盒技术

本发明专利技术提供一种用于确定人受试者中I期和II期透明细胞肾癌瘤型肾癌的复发风险的预后方法和试剂盒；所述方法包括：(a)测定来自所述人受试者的肿瘤样品(活组织检查)中微小RNA hsa‑miR‑223、hsa‑miR‑103、hsa‑miR‑107、hsa‑miR‑425、hsa‑miR‑340、hsa‑miR‑130b、hsa‑miR‑652、hsa‑miR‑214以及hsa‑miR‑204的表达水平；(b)确定取决于所述微小RNA的所述表达水平的值；以及(c)通过将步骤(b)中获得的所述值与截止值相比较来确定所述人受试者中处于I期和II期的所述透明细胞肾癌瘤型肾癌的复发风险。 1

Risk factors for recurrence of renal cell carcinoma in patients with stage I and II clear cell renal cell carcinoma and their kit

The present invention provides a prognostic method and kit for determining the recurrence risk of I and II transparent cell renal cancer type renal cancer in human subjects. The methods include: (a) determination of small RNA HSA miR 223, HSA miR miR 103, HSA miR miR 107, HSA miR. The expression level of 425, HSA, miR, miR, 130b, HSA, miR 652, HSA, miR 214, and HSA miR 204; (b) determined by the value of the expressed level of the described minute; and the comparison of the value obtained from the step and the cut-off value to determine the period and the period of the person in the subject. The risk of recurrence of clear cell renal cell carcinoma in renal cell carcinoma. One

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于确定患有I期和II期透明细胞型肾癌瘤的肾癌患者的复发风险的预后方法以及其试剂盒专利
本专利技术涉及透明细胞肾癌瘤型肾癌的预后手段。更具体地说，本专利技术涉及采用9种RNA分子(也称为"微小RNA"或"miRNA")的组对此类型的癌症的预后以确定复发风险。专利技术背景透明细胞肾癌瘤(CCRC)的发病率为每100,000个人11例，特定癌症死亡率约为35％。近年来，多种药物已在CCRC(III期和IV期)中展现临床效用，并且其中的一些(例如舒尼替尼(sunitinib)、索拉非尼(sorafenib)、依维莫司(everolimus)、阿西替尼(axitinib)以及替西罗莫司(temsirolimus))已被批准在不同治疗领域中用于治疗转移性癌症。这些药物对晚期CCRC自然史的影响使得开始大量临床试验来评估它们用于辅助治疗中是否可为患者提供益处。这些试验大部分集中于高风险群体(III-IV期以及II期的高风险患者)，但目前的参数不足以鉴定处于高复发风险中的患者。在疾病的中度期(I期和II期)，目前的治疗由完全切除肿瘤组成；另外，最近已经开发了一些涉及原位消融治疗的替代方案。在中度期，不采用药物作为辅助治疗。处于中度期的CCRC的总体复发率约为15％，并且因此超过85％的局部化期患者将不从辅助治疗中受益。WO2011039757A2描述了通过使用miRNA作为标记物对CCRC的预后。在该文件中，描述了miRNAhsa-miR-204。该文件没有公开包含根据本专利技术的9种miRNA的组，并且没有公开允许人们鉴定CCRC复发风险的预后方法。WO2010145035A1描述了根据本专利技术的miRNA中的一些作为CCRC型肾癌的标记物的用途。该文件没有公开包含根据本专利技术的9种miRNA的组，并且没有公开允许人们鉴定CCRC复发风险的预后方法。WO2013026684A1公开了CCRC型肾癌的预后和诊断方法，该方法利用一长列miRNA中的至少两种miRNA的表达型态(WO2013026684A1的图7)。该文件描述了根据本专利技术的9种miRNA，而不是9种miRNA的组。此外，该文献没有公开允许人们鉴定CCRC复发风险的预后方法，并且没有为在允许人们鉴定CCRC复发风险的预后方法中使用根据本专利技术的9种miRNA的组提供依据。所引用的三份文件都没有为设计如权利要求书中所阐述的专利技术提供任何依据。所引用的文件单独与组合均不暗示所要求保护的内容。可将本专利技术的与最接近的现有技术相关的客观技术问题定义为设计预后方法来确定处于疾病I期和II期的CCRC型肾癌的复发风险的技术问题。通过用于确定处于疾病局部化I期和II期的CCRC型肾癌的复发风险的预后方法解决了此问题，因为在本申请的权利要求书中阐述了所述方法。专利技术描述在第一方面中，本专利技术提供用于确定人受试者中I期和II期透明细胞肾癌瘤型肾癌的复发风险的预后方法；所述方法包括：(a)测定来自所述人受试者的肿瘤样品(活组织检查)中至少三种选自由以下各项组成的组的微小RNA的表达水平：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别；(b)确定取决于所述至少三种微小RNA的所述表达水平的值；(c)通过将步骤(b)中获得的所述值与截止值相比较来确定所述人受试者中处于I期和II期的所述CCRC型肾癌的复发风险。在某些实施方案中，所述至少三种微小RNA包含：hsa-miR-223(SEQIDNO:1)、hsa-miR-103(SEQIDNO:2)以及hsa-miR-107(SEQIDNO:3)。在某些实施方案中，所述至少三种微小RNA包含由以下各项组成的组的微小RNA中的至少四种、至少五种、至少六种、至少七种或至少八种：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别。在某些实施方案中，所述至少三种微小RNA包含由以下各项组成的组的微小RNA中的全部九种：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别。在某些实施方案中，确定步骤(b)中的所述值包括通过对所述微小RNA中的每一种的加权表达水平求和来得到预测分数，其中所述微小RNA中的每一种的表达水平如步骤(a)中来测定，并且其中应用于每种相应微小RNA表达水平的加权为如下的系数wi：对于hsa-miR-223wi为0.098392±5％；对于hsa-miR-103wi为0.045806±5％；对于hsa-miR-107wi为0.045869±5％；对于hsa-miR-425wi为0.163188±5％；对于hsa-miR-340*wi为0.495063±5％；对于hsa-miR-130bwi为0.374902±5％；对于hsa-miR-652wi为0.311327±5％；对于hsa-miR-214wi为-0.064772±5％；并且对于hsa-miR-204wi为-0.220399±5％。在某些实施方案中，得到所述预测分数包括根据下式对所述微小RNA中的每一种的加权表达水平求和：∑iwixi-2,896583，其中wi为权重，并且xi为微小RNAi的表达值，并且其中：对于hsa-miR-223wi为0.098392对于hsa-miR-103wi为0.045806对于hsa-miR-107wi为0.045869对于hsa-miR-425wi为0.163188对于hsa-miR-340*wi为0.495063对于hsa-miR-130bwi为0.374902对于hsa-miR-652wi为0.311327对于hsa-miR-214wi为-0.064772；并且对于hsa-miR-204wi为-0.220399。在某些实施方案中，所述截止值为0.954±5％，具体地说，所述截止值可为0.954，并且其中：如果在步骤(b)中获得的所述值大于所述截止值，那么将所述人受试者归类为处于所述透明细胞肾癌瘤型肾癌的高复发风险中；如果在步骤(b)中获得的所述值小于或等于所述截止值，那么将所述人受试者归类为处于所述透明细胞肾癌瘤型肾癌的低复发风险中。在某些实施方案中，通过使用微小RNA的至少一个微阵列来测定所述微小RNA的表达水平。在这种情况下，微阵列通常包括平面支持物，所述平面支持物上布置有多个寡核苷酸序列，所述多个寡核苷酸序列包含miRNA序列或与miRNA序列互补，从而充当探针以从含RNA样品中捕获特定miRNA序列。具体地说，本专利技术提供一种用于确定患者中处于I期和II期的CCRC型肾癌的复发风险的预后方法，所述预后方法包括：(a本文档来自技高网...

【技术保护点】
1.一种用于确定人受试者中I期和II期透明细胞肾癌瘤型肾癌的复发风险的预后方

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.09.23 ES P2015313601.一种用于确定人受试者中I期和II期透明细胞肾癌瘤型肾癌的复发风险的预后方法；所述预后方法包括：(a)测定来自所述人受试者的肿瘤样品(活组织检查)中至少三种选自由以下各项组成的组的微小RNA的表达水平：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别；(b)确定取决于所述至少三种微小RNA的所述表达水平的值；(c)通过将步骤(b)中获得的所述值与截止值相比较来确定所述人受试者中处于I期和II期的所述CCRC型肾癌的复发风险。2.根据权利要求1所述的预后方法，其中所述至少三种微小RNA包含：hsa-miR-223(SEQIDNO:1)、hsa-miR-103(SEQIDNO:2)以及hsa-miR-107(SEQIDNO:3)。3.根据权利要求1或权利要求2所述的预后方法，其中所述至少三种微小RNA包含由以下各项组成的组的微小RNA中的至少四种、至少五种、至少六种、至少七种或至少八种：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别。4.根据前述权利要求中任一项所述的预后方法，其中所述至少三种微小RNA包含由以下各项组成的组的微小RNA中的全部九种：hsa-miR-223、hsa-miR-103、hsa-miR-107、hsa-miR-425、hsa-miR-340、hsa-miR-130b、hsa-miR-652、hsa-miR-214以及hsa-miR-204，其序列由序列SEQIDNO:1-9来鉴别。5.根据前述权利要求中任一项所述的预后方法，其中确定步骤(b)中的所述值包括通过对所述微小RNA中的每一种的加权表达水平求和得到预测分数，其中所述微小RNA中的每一种的所述表达水平如步骤(a)中来测定，并且其中应用于每种相应微小RNA表达水平的所述加权为如下的系数wi：对于hsa-miR-223wi为0.098392±5％；对于hsa-miR-103wi为0.045806±5％；对于hsa-miR-107wi为0.045869±5％；对于hsa-miR-425wi为0.163188±5％；对于hsa-miR-340*wi为0.495063±5％；对于hsa-miR-130bwi为0.374902±5％；对于hsa-miR-652wi为0.311327±5％；对于hsa-miR-214wi为-0.064772±5％；并且对于hsa-miR-204wi为-0.220399±5％。6.根据权利要求5所述的预后方法，其中得到所述预测分数包括根据下式对所述微小RNA中的每一种的所述加权表达水平求和：∑iwixi-2,896583，其中wi为权重，并且xi为微小RNAi的表达值，并且其中：对于hsa-miR-223wi为0.098392对于hsa-miR-103wi为0.045806对于hsa-miR-107wi为0.045869对于hsa-miR-425wi为0.163188对于hsa-miR-340*wi为0.495063对于hsa-miR-130bwi为0.374902对于hsa-miR-652wi为0.311327对于hsa-miR-214wi为-0.064772；并且对于hsa-miR-204wi为-0.220399。7.根据前述权利要求中任一项所述的预后方法，其中所述截止值为0.954±5％或为0.954，并且其中：如果在步骤(b)中获得的所述值大于所述截止值，那么将所述人受试者归类为处于所述透明细胞肾癌瘤型肾癌的高复发风险中；如果在步骤(b)中获得的所述值小于或等于所述截止值，那么将所述人受试者归类为处于所述透明细胞肾癌瘤型肾癌的低复发风险中。8.根据前述权利要求中任一项所述的预后方法，其中所述微小...

【专利技术属性】
技术研发人员：N·米兰达乌得勒拉，F·维拉坎巴奥巴，D·卡斯特利亚诺，J·á·弗雷斯诺瓦拉，A·戈麦斯波佐，
申请(专利权)人：十月十二日医院生物医学研究基金会，和平大学医院生物医学研究基金会，
类型：发明
国别省市：西班牙,ES