在数字病理学中的信息转换制造技术

本发明专利技术涉及一种在样品载玻片（14）处的注释（22）的图示。本发明专利技术的意图是将在参考载玻片（12）处提供的注释（22）拷贝到样品载玻片（14）。典型地，特别是通过扫描参考载玻片（12）而提供参考载玻片（12）的参考图像（26）。参考图像（26）因此具有关于由参考载玻片（12）承载的参考切片（16）的信息。另外，参考载玻片（12）已被标记有感兴趣区域（20）和注释（22），该注释可以与感兴趣区域（20）关联。如果这种参考载玻片（12）被扫描，各个参考图像（26）也包含关于所标记感兴趣区域（20）以及注释（22）的信息。另外，承载样品切片（18）的样品载玻片（14）可以被扫描，以便提供样品图像（28）。样品切片（18）和参考切片（16）切割自从生物材料的同一对象（10）。特别地，紧接着在材料块的切割已被进行以提供参考切片（18）之后，样品切片（16）被切割。由于参考切片（16）和样品切片（18）来自同一对象（10），它们的特征是非常可能使得参考图像（26）和样品图像（28）非常相似。由于此相似性，参考载玻片（12）的注释（22）基于在参考图像（26）和样品图像（28）之间的图像辨别而被拷贝到样品载玻片（14）。

Information conversion in digital pathology

The present invention relates to an illustration of the annotation (22) at the sample slide (14). The intent of the present invention is to copy the annotation (22) provided at the reference slide (12) to the sample slide (14). Typically, reference images (26) of reference slides (12) are provided by scanning reference slides (12) in particular. The reference image (26) therefore has information about reference slices (16) carried by reference slides (12). In addition, reference slides (12) have been marked with regions of interest (20) and notes (22), which can be associated with the region of interest (20). If the reference slide (12) is scanned, each reference image (26) also contains information about the marked area of interest (20) and the annotation (22). In addition, the sample slide (14) carrying the sample slicing (18) can be scanned to provide sample images (28). Samples were sliced (18) and reference slices (16) were cut from the same object (10) of biomaterials. In particular, after the cutting of the material block has been carried out to provide reference slices (18), the sample slicing (16) is cut. Since the reference slices (16) and sample slices (18) are from the same object (10), their characteristics are very likely to make the reference image (26) very similar to the sample image (28). As a result of this similarity, the annotation (22) of the reference slide (12) is copied to the sample slide (14) based on the image discrimination between the reference image (26) and the sample image (28).

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】在数字病理学中的信息转换
本专利技术涉及数字病理学，并且特别地涉及在承载生物材料的切片的载玻片之间的注释的转换。
技术介绍
病理学家在治疗周期的诊断部分中具有核心作用。当生物材料样品在活检期间从病人取得时，通常是病理学家通过对来自活检的组织和细胞的显微检查而作出关于潜在疾病的性质和严重性作出最终诊断。在一示例中，用于显微检查的载玻片可以在下述的若干步骤中被制备。首先，生物材料样品可以安放在福尔马林中用于固定并且随后被处理到石蜡块中，从该石蜡块切割得到薄的约5μm的切片。这些切片的一个然后安放在载玻片的基底上，特别地安放在玻璃基底上，此后一个或者多个染色物质可以被应用，使得相关的细胞或者组织部分利用显微镜是可见的。之后，匹配的液体和/或固定剂可以添加至切片。另外，薄的（约170μm）、透明的盖玻片可以被安放到切片的顶部，使得该切片被密封。这使包括该切片的该载玻片的长期存储（特别地多于10年）成为可能。尽管病理学典型地是模拟的职业，近期已经存在朝向数字病理学的移动，以便改善诊断效率和质量。数字病理学指的是用于在生物学、组织学和/或病理学的领域中分析生物材料（特别是切片）的所需要信息的数字化。特别地，数字病理学指的是先前已经从生物材料样品切割的切片的数字分子诊断。数字病理学的示例性适配将导致病理学家本身不再物理地处理该载玻片，而是利用数字图像工作，数字图像可以从载玻片和其他临床信息取得以用于做出他或者她的诊断。使用合适的分切技术（例如，通过激光的微分切），一个或者若干个小组织样品可以从由载玻片的基底承载的切片切割得到。小组织样品可以经历另外分子测试，诸如DNA基因分型或者RNA转录成型。典型地，病理学家在切片选择一个或者若干个感兴趣区域，该切片可以经历先前解释的分切技术。经常，这个选择通过在载玻片的背侧上做标记而作出。操作者可以然后使用聚焦激光束用于沿着该标记的线而切割，其将感兴趣区域和周围组织样品区域分开。所分开的组织样品然后被提取用于经历另外分子诊断。US2012/0045790A1涉及一种微型分切方法和一种信息处理系统。为了方便在生物材料样品中选择感兴趣区域以及在该感兴趣区域提取组织样品的步骤，基于数字图像中的感兴趣区域而确定样品切片中的感兴趣区域被提供，其中样品组织在各个感兴趣区域从该样品切片被提取。切片的实际处理已经示出，切片可以具有多于一个的感兴趣区域。这种感兴趣区域典型地彼此隔开。为了识别不同的感兴趣区域，注释可以被提供至载玻片，特别地在载玻片的背侧。因此，与感兴趣区域关联的注释可以含有用于识别感兴趣区域的识别符。另外注释可以被提供至载玻片，特别是对于切片的评论、对于肿瘤细胞的估计的百分比注解、或者在诊断信息的上下文中会是相关的任何其他信息。典型地，病理学家注释所谓的参考载玻片，在至少一个感兴趣区域被标记在该参考载玻片。另外，所谓的样品载玻片（每个包含样品切片）被提供。优选地，参考载玻片的参考切片和样品载玻片的样品切片从生物材料切割得到，该生物材料可以具有块形式。参考切片和样品切片典型地被发送至实验室，在实验室中技术人员通常基于参考载玻片的信息而人工地识别在与参考载玻片的感兴趣区域对应的至少一个样品载玻片处的区域。因此，当处理样品载玻片时，存在注释的人工痕迹。
技术实现思路
会存在便于在参考载玻片处提供的信息到样品载玻片的转换的需求，其中参考载玻片和样品载玻片含有同一生物材料块的切片。本专利技术的目的由各独立权利要求的主题解决，其中另外实施例被结合在从属权利要求中。根据本专利技术的第一方面，提供一种装置，其包含参考提供单元、样品提供单元、辨别单元、确定单元和图示单元。参考提供单元配置成提供参考载玻片的数字参考图像并且在参考图像中提供数字注释，参考载玻片包含对象的参考切片，对象包含生物材料。样品提供单元配置成提供样品载玻片的数字样品图像，该样品载玻片包含对象的样品切片。辨别单元配置成在参考图像和样品图像之间进行辨别以提供参考图像和样品图像之间的空间链接。确定单元配置成基于空间链接确定用于在样品载玻片处的注释的注释位置。图示单元配置成在样品载玻片处的注释位置处物理地图示注释。为了方便样品载玻片的处理和/或由样品载玻片承载的样品切片的样品组织的分切，该装置提供这样的优点，相关注释可见地直接地出现在载玻片上，其中在样品载玻片处的注释的布置对应于在参考载玻片处的注释的布置。因此，对于载玻片的形状或者载玻片的任何其他特征特别是与感兴趣区域的关联可以被维持。例如，在注释已被布置靠近在参考载玻片处的感兴趣区域以便实现在感兴趣区域和注释之间的关联的情况中，各个注释可以按相似布置被提供在样品载玻片处。在感兴趣区域也被提供到样品载玻片的情况中，该靠近布置也可以出现。特别地，可以通过注释而识别注释和感兴趣区域之间的期望关联。因此，来自样品载玻片的样品切片的样品组织的分切被简化，这是由于技术人员可以容易地识别感兴趣区域。另外，注释可以被用于验证目的。在一示例中，该装置涉及优选地在生物学、组织学和/或病理学领域中的一种用于诊断，特别是用于分子诊断的装置。在一另外示例中，该装置被用于显微镜或者与显微镜一起使用。包含生物材料的对象涉及生物材料的样品，特别是形成材料的块。因此，“对象”也可以称为“对象样品”、“材料样品”或者“对象块”。术语“切片”涉及对象的一件样品材料，特别是作为以优选地薄（例如约5μm）切片的形式的从对象的切割部分。在一示例中，载玻片涉及被提供用于支持和/或承载切片的载体，特别是用于诊断目的。载玻片也可以配置成用于存档目的，特别是用于存储切片。在一示例中，术语“空间链接”指的是参考图像的特征和样品图像的特征之间的转换规则。在一示例中，数字参考图像指的是承载参考切片的参考载玻片的数字图像。在一示例中，数字样本图像指的是承载样品切片的样品载玻片的数字图像。在一示例中，注释涉及注解、标记、文本、手迹、绘画、记号、图、符号和/或图标的至少一种。在一示例中，术语“物理地图示注释”涉及注释的实际或者真实的出现。根据一示例性实施例，参考切片是对象的染色的切片，并且样品切片是对象的未染色的或者不同地染色的切片。术语“染色的”涉及着色。染色可以提升切片的对比度和/或突出切片的具体感兴趣特征。术语“未染色的”涉及未被与染色物质的化学相互作用采用的切片。术语“不同地染色的”涉及使用于染色的不同化学染色物质。例如，H&E染色的切片与H染色的切片是不同地染色的。在样品切片是未染色的或者不同地染色的情况中，样品切片的相关细胞或者相关部分会是不可见的。但是通过在样品载玻片上，并且因此特别地直接地在样品切片上物理地图示注释，利用注释提供的信息将便于样品载玻片的处理。在一示例中，图示可以帮助识别样品载玻片或者样品切片的相关区域。在一另外示例中，注释的该图示可以提供与样品切片的感兴趣区域关联的相关信息。根据一示例性实施例，图示单元被进一步配置成在样品载玻片的样品切片处物理地图示该注释。结果，注释可以在样品切片上可见地直接地出现。这可以便于样品切片的样品组织的分切。根据一示例性实施例，图示单元包含投影机或者显示器以将光投射到样品载玻片上，以可见地图示注释和/或移除的区域。结果，注释可以在样品切片上可见地直接地出现而不改变样品载玻片或者样品本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种装置（32），包含：参考提供单元（34），其配置成提供参考载玻片（12）的数字参考图像（26）并且在该参考图像中提供数字注释（22），该参考载玻片包含对象（10）的参考切片（16），该对象包含生物材料；样品提供单元（36），其配置成提供样品载玻片（14）的数字样品图像（28），该样品载玻片包含该对象的样品切片（18）；辨别单元（38），其配置成在该参考图像和该样品图像之间进行辨别以提供该参考图像和该样品图像之间的空间链接；确定单元40，其配置成基于该空间链接确定用于在该样品载玻片处的该注释的注释位置（42）；和图示单元（44），其配置成在该样品载玻片处的该注释位置处物理地图示该注释。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.07.16 EP 15176980.91.一种装置（32），包含：参考提供单元（34），其配置成提供参考载玻片（12）的数字参考图像（26）并且在该参考图像中提供数字注释（22），该参考载玻片包含对象（10）的参考切片（16），该对象包含生物材料；样品提供单元（36），其配置成提供样品载玻片（14）的数字样品图像（28），该样品载玻片包含该对象的样品切片（18）；辨别单元（38），其配置成在该参考图像和该样品图像之间进行辨别以提供该参考图像和该样品图像之间的空间链接；确定单元40，其配置成基于该空间链接确定用于在该样品载玻片处的该注释的注释位置（42）；和图示单元（44），其配置成在该样品载玻片处的该注释位置处物理地图示该注释。2.根据权利要求1所述的装置，其中该参考切片是该对象的染色的切片，并且该样品切片是该对象的未染色的或者不同地染色的切片。3.根据权利要求1或2其中一项所述的装置，其中该图示单元进一步配置成在该样品载玻片的该切片处物理地图示该注释。4.根据权利要求1至3其中一项所述的装置，其中该辨别包含：该样品图像中的该参考图像的特征的图像辨别，和/或该参考图像和该样品图像的图像配准以提供该参考图像的配准特征和该样品图像的配准特征之间的该空间链接。5.根据权利要求1至4其中一项所述的装置，其中该参考提供单元配置成在该参考图像处提供参考移除区域（48），其中该参考注释是数字注解，该数字注解提供对于该参考移除区域的另外信息。6.根据权利要求5所述的装置，其中该确定单元进一步配置成基于该空间链接确定用于在该样品载玻片处的该移除区域的移除位置（50）；并且该图示单元进一步配置成在该样品载玻片处的该移除位置处物理地图示该移除区域。7.根据权利要求1至6其中一...

【专利技术属性】
技术研发人员：JP温克，R维鲁特斯，A皮伊里克，B胡斯肯，R维姆伯格弗里伊德，S尼肯，
申请(专利权)人：皇家飞利浦有限公司，
类型：发明
国别省市：荷兰,NL