本发明专利技术涉及一种通过测定在单倍型标记内的一种或多种多态性位点上核苷酸的存在来诊断或预测对于治疗的反应的方法，所述治疗如Ａｌｅｆａｃｅｐｔ。本发明专利技术鉴定了与对于Ａｌｅｆａｃｅｐｔ的反应相关联的多种单倍型。本发明专利技术鉴定的单倍型标记和本发明专利技术的方法能够对于诊断或预测对皮肤疾病，如牛皮癣的易感性特别有用。
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】相关申请本申请要求2004年5月4日递交的美国临时申请60/568,371的权益，特此将其全部内容并入本文作为参考。
技术介绍
DNA的变异或突变几乎与所有人类表型特征和疾病直接相关。最常见的DNA变异类型是单核苷酸多态性(SNP)，其是在基因组中单一位置上的碱基对取代。据估计SNPs导致人之间大部分的DNA序列差异(Patil，N.等，Science，2941719(2001))。在基因组中紧密物理接近的这些SNPs组块经常是遗传连锁的，导致群体内遗传变异性减少并定义有限数目的″SNP单倍型″，其每一种都反映了来自单一的，古老染色体的血统(Stephens，J.C.，Molec.Diag.4(4)309-317；Fullerton，S.M.，等，Am.J.Hum.Genet.67881(2000))。由SNPs，单倍型或者其它类型的变异定义的人DNA序列变异模式，对于鉴定表型特征和基因位点之间的关联具有重要暗示。例如，可以进一步分析具体的目标基因组区以便将SNPs或者单倍型与表型特征-例如，疾病易感性或抗性，对于遗传病症的易感性，或药物反应相关联。这种信息可能在理解所述特征的生物学基础以及鉴定可用于发展治疗剂和诊断剂的候选基因中是无价的。牛皮癣是一种最常见的皮肤病(dermatologic disease)(本文还称作皮肤病(skin desease))，其影响高达1到2％的世界人群。它是一种慢性炎症性皮肤病症，临床特征红斑性的，明显分界的丘疹和圆斑，覆以银色的云母状鳞屑。受损区域经常发展成牛皮癣损伤(Koebner或者同形现象)。此外，包括感染，胁迫，和药物的其它外部因素可以加剧牛皮癣。大约5到10％的牛皮癣患者有相关联的关节疾病，这些大多数常常发现于具有染及指甲的患者中。尽管一些人同时患有典型的风湿性关节炎，但许多人患有关节疾病。对于牛皮癣的病因仍然知之甚少。很明显牛皮癣有遗传性<220><221>等位基因<222>(12027)..(12027)<223>PS15多态碱基鸟嘌呤或者腺嘌呤<220><221>等位基因<222>(16448)..(16448)<223>PS21多态碱基鸟嘌呤或者腺嘌呤<220><221>不确定<222>(17114)..(17214)<223>N′s代表未知核苷酸<220><221>等位基因<222>(25065)..(25065)<223>PS26多态碱基腺嘌呤或者鸟嘌呤<220><221>等位基因<222>(25139)..(25139)<223>PS27多态碱基胞嘧啶或者胸腺嘧啶<220><221>等位基因<222>(25215)..(25215)<223>PS28多态碱基胞嘧啶或者胸腺嘧啶<400>1cactaatatt tagaggttaa tttatcacag acgcaagagt ttccataact aatgcatcca 60ggggttccct gtctatgatt ttagacaata cctgacaaag cagtgagtaa cttttaatca 120tttactgaga aagttgttcc ttttgcaatg ctgtggcgcc catgagagag tggatagaaa 180gaggtagctt gtgttttcta aacaacaaat actttgaata cacatacaaa gaagaaatac 240aaatggccaa caagcacatg aattgatgct taacatcatt tctcattcag gaagtacaaa 300tccaaaccac aatgagatat cacttcacac ccactaggat ggaacaaaac aaaaacagaa 360aataacaagt gttggcgatg atgtggggaa attggaaccc tttcattgtt ggcagaaatg 420taaatggtca cagctgctat ggaaatcagt tggttagtcc ctcaaaaagt taaacataga 480attattgtat gacccagcaa ttgcactgcc tgagtacata cctgaaagaa ttgaaaacag 540gcacccaaac atatatttgt acaagaatgt tcacagtagc attactcaca aaagtcaaaa 600agtagatata gtagcccact caaatgtcca tcattagatg aacagataaa gaaaatgtgg 660tatatacagg tacatacaca aaatattact caacaataag aagaaatggt gctataatgg 720ggatgaacct gaaaaacatt gcgctgagtc aaagaagcca ttcgctaaag accacacatt 780gtatgggagc caaggcagta tccagcgaga ctctggcctc tggctgggct gagtgacttc 840ttttccccca gtgcctttga actctctgca cccaactcag ccatgagcaa tgctgtcacc 900agcaatgggc agaggggctg gggcaagagt gggatggaaa gaatactgga tgtggagacc 960aaatgtgaca gtgtccttgc ccggctgcct gctttagatc tcaggggaca cgccatttcc 1020tctccgataa actctaagct cttagggtaa cccatggacc tgcctggctg ggtctttgtt 1080内一个或多个多态性位点上存在的核苷酸。在其它实施方案中，该方法包括分析来自所述受试者的样品以确定对于T细胞激活或抑制单倍型来说受试者的拷贝数。所述T细胞激活或抑制单倍型可以是，例如，在表1中给出的任何一种基因中的单倍型，例如，在CD8B1，SPR1，TCF19，或者HCR基因中的单倍型。本专利技术进一步提供了一种方法，其通过测定基因型来确定受试者对治疗的反应，所述基因型例如，在来自受试者的样品中T细胞激活或抑制单倍型内，存在于一条或多条染色体上的一个或多个多本文档来自技高网...
【技术保护点】
一种确定受试者对于用Ｔ细胞损耗剂进行治疗的反应的方法，包括在来自所述受试者的样品中确定Ｔ细胞激活或抑制单倍型内一个或多个多态性位点上存在的核苷酸，由此基于在所述Ｔ细胞激活或抑制单倍型中一个或多个多态性位点上存在于所述受试者内的核苷酸来确定受试者对于用Ｔ细胞损耗剂进行治疗的反应。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】...
【专利技术属性】
技术研发人员：B科希，BJ达因，MK阿南特，詹萍，
申请(专利权)人：杰耐萨斯药品公司，
类型：发明
国别省市：US[]
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