Methods, systems and devices for detecting subgroups of the composition of at least one biological organism are disclosed. According to the exemplary embodiment, we will formalize biological data compiled from at least one biological organism's composition group (112) as a set of discrete real valued vector signals. In addition, the vector signals of biological data are performed (114) in frequency domain analysis to compile the spectral properties of the vector signals. The spectral properties can be used to detect the subgroups of the group effectively and maintain the accuracy of the height.
【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】用于根据生物学数据的亚群检测的方法、系统和装置
本专利技术总体涉及生物信息学技术。更具体地,在本文中所公开的各种创造性的方法、系统和装置涉及基于生物学数据对亚群的检测。
技术介绍
生物信息学技术提供了用于分析生物学有机体的有效手段,并且是若干生物学领域的重要方面。具体地,生物信息学技术过程已经在基因组学以及对包括癌症的疾病的研究和处置方面取得了重大进展。癌症以及其他基因组疾病的特征在于基因组结构变异和基因表达的异种模式,其支持从正常细胞向肿瘤细胞的演变。出于临床研究的目的,并且特别是在肿瘤发展和增殖中的驾驶员和乘客事件的识别,根据可用基因组数据来解读和表征独特模式的能力获得高度重视。用于推断肿瘤中的克隆群体结构的一种方法采用贝叶斯假设测试。该方法应用聚类流程,所述聚类流程将多组测序的体细胞突变分组成克隆聚类。
技术实现思路
基因简档的复杂性和容量使得非常难以出于检测各种亚群的目的而对其进行有效且准确地分析,所述亚群例如包括反映肿瘤细胞谱系和演变的克隆群体,以及异常、正常和疾病特异性细胞系的群体。本公开涉及用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的专利技术方法、系统和装置。为了在维持高度准确性的同时提高对亚群的检测效率,根据本专利技术的一方面,将生物学数据形式化(formulate)为离散时间实值向量信号,并且使用一个或多个频域分析流程进行评估。在此,所述信号能够由基因组的特性来定义,其中,基因组的沿着基因组长度的区域能够被表示为时间值。此外,能够通过(一种或多种)频域分析流程来获得信号的谱性质,并且将其用作用于区分亚群的特征。因此,通过将生物学数据形式化为离散 ...
【技术保护点】
一种用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的系统(100),所述系统由至少一个硬件处理器来实施,并且所述系统包括:向量信号形式化模块(112),其被配置为将根据所述至少一个生物学有机体的所述组成的群组而编译的生物学数据形式化为存储介质(108)的至少一个数据结构内的离散时间实值向量信号的集合;频域分析器(114),其被配置为对所述生物学数据的所述向量信号执行频域分析以编译所述向量信号的谱性质,并且被配置为将所述谱性质与所述群组的所述组成相关联;以及亚群检测模块(118),其被配置为通过向所述谱性质应用相似性度量来识别所述至少一个生物学有机体的所述亚群,并且被配置为引导对所述识别的亚群的表示的显示。
【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2015.06.02 US 62/169,9021.一种用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的系统(100),所述系统由至少一个硬件处理器来实施,并且所述系统包括:向量信号形式化模块(112),其被配置为将根据所述至少一个生物学有机体的所述组成的群组而编译的生物学数据形式化为存储介质(108)的至少一个数据结构内的离散时间实值向量信号的集合;频域分析器(114),其被配置为对所述生物学数据的所述向量信号执行频域分析以编译所述向量信号的谱性质,并且被配置为将所述谱性质与所述群组的所述组成相关联;以及亚群检测模块(118),其被配置为通过向所述谱性质应用相似性度量来识别所述至少一个生物学有机体的所述亚群,并且被配置为引导对所述识别的亚群的表示的显示。2.根据权利要求1所述的装置,其中,所述生物学数据包括基因组数据或蛋白质组数据中的至少一个。3.一种用于检测至少一个生物学有机体的组成的亚群的方法(200),所述方法由至少一个硬件处理器来实施,并且所述方法包括:将根据所述至少一个生物学有机体的所述组成的群组而编译的生物学数据形式化(204)为存储介质的至少一个数据结构内的离散时间实值向量信号的集合;对所述生物学数据的所述向量信号执行(206)频域分析以编译所述向量信号的谱性质;将所述谱性质与所述群组的所述组成相关联(208);并且通过向所述谱性质应用相似性度量来识别(210)所述至少一个生物学有机体的所述组成的所述亚群。4.根据权利要求3所述的方法,其中,所述生物学数据包括基因组数据或蛋白质组数据中的至少一个。5.根据权利要求4所述的方法,其中,所述谱性质包括功率谱密度或总谱能量中的至少一个。6.根据权...
【专利技术属性】
技术研发人员:K·沃良斯基,N·迪米特罗娃,
申请(专利权)人:皇家飞利浦有限公司,
类型:发明
国别省市:荷兰,NL
还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。