一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒和系统技术方案

技术编号:15602045 阅读:178 留言:0更新日期:2017-06-13 23:43
本发明专利技术提供了一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括扩增环状RNA的引物,所述环状RNA包括hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269。通过综合分析上述四种环状RNA在Ⅲ期胃癌患者癌组织中的表达水平,达到预测患者接受手术切除肿瘤后复发危险度的目的。本发明专利技术还提供了一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的系统,采用本发明专利技术的系统,通过检测Ⅲ期胃癌术后患者的四种环状RNA的含量,基于这一系统计算患者的危险度,则可判断该类病人复发的可能性;相比现有的检测方法具有定量、准确、样品收集方便等特点。

【技术实现步骤摘要】
一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒和系统
本专利技术涉及一种试剂盒,具体涉及一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒和系统。
技术介绍
胃癌(gastriccancer,GC)是世界十大恶性肿瘤之一,也是消化系统最常见的恶性肿瘤。根据世界卫生组织(worldhealthorganization,WTO)统计结果表明,日本、韩国和中国等东亚国家是胃癌高发区,而美国、新西兰和澳大利亚等国家是胃癌低发区。在世界范围内,胃癌的发病率位居恶性肿瘤的第四位,死亡率位居恶性肿瘤的第二位。在我国,胃癌的发病率和死亡率都位居恶性肿瘤的前列。根据全国范围的死亡原因调查发现,因恶性肿瘤死亡位居男性和女性死亡原因的第二位和第三位。虽然在近几十年来胃癌的基础和临床研究取得了一些进步,但是胃癌的诊断和治疗现状仍然不容乐观。胃癌患者的五年总生存率不到24%。大部分胃癌诊断时已经是中晚期,即使对其进行了以手术治疗为主的综合治疗,约60%的患者依然出现复发转移,这将严重影响胃癌患者的预后。胃癌侵袭转移的防治在很长一段时间内都是人类战胜胃癌必须要解决的重大问题。仅仅只针对胃癌原发病灶的治疗已经证实效果是不十分理想。需要在关注胃癌原发灶的同时,花大力气去探索胃癌侵袭转移的机制,能够找到新的诊断标志物,有利于胃癌的早期诊断;新的预后分子标记物,有利于胃癌患者预后的预测;新的治疗靶点,为胃癌患者的个体化治疗提供依据。这将对胃癌的诊断与治疗的进步奠定扎实的基础。Ⅲ期胃癌通常在诊断后行根治性切除,但是切除后许多病例往往在一年内发生复发或转移,这使得Ⅲ期胃癌的预后通常很差。而普通临床标志物(如TNM分期、Lauren’s分型)难以对Ⅲ期胃癌的复发作出准确的预测,因此需要寻找更加稳定准确的因子作为肿瘤复发的标记物,对可能复发的高位病例进行更加严格的监控预防,从而更好的预防Ⅲ期胃癌的复发和转移。人体中编码蛋白质的基因大约有2-3万个,仅占人类基因组的2%,其余98%不编码蛋白质的基因组DNA最初被认为是没有功能的,是生物体中的垃圾,通常被称为“垃圾DNA”。但目前的研究表明,这些垃圾DNA大多可转录产生非编码RNA(non-codingRNA,ncRNA)。根据成熟转录本形状的不同,ncRNA可分为线性RNA分子和环状RNA分子。目前,ncRNA领域研究较多的是线性RNA,而对环状RNA的研究还处于起步阶段。近年来环状RNA的研究越来越受到重视。数篇重要的研究论文揭示出一些环状RNA充当分子“海绵”,结合并封闭了称作microRNAs的微小基因调控子。此外,研究人员推测环状RNAs还具有许多其他的功能。这一发现再次提醒人们:RNA并不仅仅是DNA与编码蛋白之间的一个平凡信使。在过去的20年里,研究人员发现了大量的非常规RNA。一些长度意想不到的短,一些则长到令人感到惊讶,而另一些则颠覆常规具有阻止其他RNA链翻译形成蛋白质的功能。这一发现使得利用环状RNA作为胃癌的术后诊断标准成为了可能。环状RNA可以作为疾病的生物标记物。已有研究发现环状RNA有较强的组织表达特异性。cANRIL是一个INK4A0ARF的反义转录本,cANRIL的表达可能与INK4/ARF的转录和心血管硬化疾病风险相关。另外,研究人员发现hsa_circ_002059在胃癌中表达下调,是一个潜在的胃癌诊断的肿瘤标志物。肝癌细胞外泌体的环状RNA测序发现,环状RNA在外泌体中大量富集且于正常细胞相比差异很大,同时血清中肿瘤环状RNAs的富集程度甚至与肿瘤的大小有关。这些都表明环状RNA是未来疾病诊断的潜在靶点。通过发现Ⅲ期胃癌术后复发相关环状RNA并通过建立模型得到诊断试剂盒,会对Ⅲ期胃癌术后复发和治疗具有重要的临床指导意义。
技术实现思路
本专利技术的目的在于克服现有技术存在的不足之处而提供了一种预测Ⅲ期胃癌术后早期复发的试剂盒和系统。为实现上述目的,所采取的技术方案:一种预测Ⅲ期胃癌术后早期复发的试剂盒,所述试剂盒包括扩增环状RNA的引物,所述环状RNA包括hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269。所述hsa_circRNA_101308的cDNA序列如SEQIDNo.1所示,所述hsa_circRNA_104423的cDNA序列如SEQIDNo.2所示,所述hsa_circRNA_104916的cDNA序列如SEQIDNo.3所示,所述hsa_circRNA_100269的cDNA序列如SEQIDNo.4所示。优选地,所述扩增hsa_circRNA_101308的引物包括序列如SEQIDNo.5所示的上游引物和序列如SEQIDNo.6的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_104423的引物包括序列如SEQIDNo.7所示的上游引物和序列如SEQIDNo.8的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_104916的引物包括序列如SEQIDNo.9所示的上游引物和序列如SEQIDNo.10的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_100269的引物包括序列如SEQIDNo.11所示的上游引物和序列如SEQIDNo.12的下游引物。优选地,所述试剂盒还包括逆转录酶及逆转录酶的反应缓冲液、随机逆转录引物、荧光定量PCR反应缓冲液、内参、阴性对照、试剂盒使用说明书。本专利技术提供了hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269的联合使用在制备预测Ⅲ期胃癌术后早期复发的试剂盒中的用途。本专利技术提供了一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的系统,包括:数据输入模块,用于将Ⅲ期胃癌患者术后的分子指标的qPCR检测结果输入模型计算模块,所述分子指标包括hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269;模型计算模块,包括危险度评分模型,用于根据Ⅲ期胃癌患者术后分子指标的qPCR检测结果以及危险度评分模型计算患者危险度评分结果;结果输出模块,用于根据危险度评分结果判定Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的可能性;当患者危险度评分<-1时,患者术后早期复发的可能性低;当患者危险度评分≥-1时,患者术后早期复发的可能性高。优选地,所述患者分子指标的qPCR检测结果是将分子指标的qPCR检测值与分子指标的qPCR检测阈值比较后得到的,分子指标的qPCR检测值大于分子指标的qPCR检测阈值,分子指标的结果为高表达,用数字1表示;分子指标的qPCR检测值小于等于分子指标的qPCR检测阈值,分子指标的结果为低表达,用数字0表示;hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269的qPCR检测阈值分别为-9.09、-12.24、-10.26和-11.51;所述危险度评分模型包括危险度评分公式,危险度评分=(1.434×hsa_circRNA_101308)-(0.917×hsa_circRNA_104423)-(1本文档来自技高网
...
一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒和系统

【技术保护点】
一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括扩增环状RNA的引物,所述环状RNA包括hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269。

【技术特征摘要】
1.一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括扩增环状RNA的引物,所述环状RNA包括hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269。2.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述扩增hsa_circRNA_101308的引物包括序列如SEQIDNo.5所示的上游引物和序列如SEQIDNo.6的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_104423的引物包括序列如SEQIDNo.7所示的上游引物和序列如SEQIDNo.8的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_104916的引物包括序列如SEQIDNo.9所示的上游引物和序列如SEQIDNo.10的下游引物;所述扩增hsa_circRNA_100269的引物包括序列如SEQIDNo.11所示的上游引物和序列如SEQIDNo.12的下游引物。3.根据权利要求1所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括逆转录酶及逆转录酶的反应缓冲液、随机逆转录引物、荧光定量PCR反应缓冲液、内参、阴性对照、试剂盒使用说明书。4.hsa_circRNA_101308、hsa_circRNA_104423、hsa_circRNA_104916和hsa_circRNA_100269的联合使用在制备预测Ⅲ期胃癌术后早期复发的试剂盒中的用途。5.一种预测Ⅲ期胃癌患者术后早期复发的系统,其特征在于,包括:数据输入模块,用于将Ⅲ期胃癌患者术后的分子指标的qPCR...

【专利技术属性】
技术研发人员:祁小龙李国新张研
申请(专利权)人:南方医科大学南方医院
类型:发明
国别省市:广东,44

网友询问留言 已有0条评论
  • 还没有人留言评论。发表了对其他浏览者有用的留言会获得科技券。

1