基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统技术方案

本发明专利技术涉及基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统，所述系统包括：(1)胶质瘤患者肿瘤石蜡包埋试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；(2)免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(3)免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中IDH1-R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书。当联合IDH1-R132H和ATRX损失作为诊断标志物区分原发胶质母细胞瘤、WHO分级II/III的少突胶质细胞瘤、WHO分级II/III的星形细胞瘤和继发胶质母细胞瘤，其中诊断特异性明显高于IDH1-R132H或ATRX损失状况这两个单一标记物。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及疾病分型领域，特别是涉及基于IDH1-R132H和ATRX的胶质瘤分型系统。
技术介绍
根据WHO的分类，弥散性胶质瘤分为II级、III级和胶质母细胞瘤的星形细胞胶质瘤、少突星形胶质瘤和少突胶质瘤。较低级别胶质瘤(LGGs，II级)的患者比高级别胶质瘤(III级和IV级)的患者具有更有利的预后，在50-75％的低级别胶质瘤患者中，肿瘤继续生长和发展成为更高级别，导致神经疾病和最终死亡。星形细胞瘤是脑肿瘤中最常见的病理类型，极易复发或恶性进展，即使经过手术、放疗和化疗也很难治愈。恶性的星形细胞瘤如胶质母细胞瘤是最致命的颅内肿瘤。星形细胞瘤患者预后取决于某些临床因素，如发病年龄、KPS评分、手术切除范围、病理类型、肿瘤级别和分子标记物特征。当前，胶质瘤诊断仅以形态学为基础，难以明确客观地诊断胶质瘤病理类型，也不能全面反映肿瘤的生物学行为，不能准确判断患者预后和指导术后临床治疗。IDH(isocitratedehydrogenase，异柠檬酸脱氢酶)和ATRX(X-linkedalphathalassaemiamentalretardation)的突变在胶质瘤发生的早期出现和表征胶质瘤的特定亚型。多数致癌IDH1突变是杂合错义突变，在395位置(G395A)G变为A，导致了在酶活性位点密码子132(IDH1-R132H)的精氨酸被组氨酸替代。ATRX突变或损失影响星形胶质细胞的生物学行为，与星形胶质细胞肿瘤患者的有利生存有关。
技术实现思路
本专利技术目的是提供一种基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统。在一种实施方式中，基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统，它包括：(1)检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(2)检测胶质瘤患者肿瘤中IDH1-R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书。在一种实施方式中，基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统，所述系统包括：(1)胶质瘤患者肿瘤石蜡包埋试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；(2)免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(3)免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中IDH1-R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书。在一种实施方式中，IDH1-R312H染色的评估标准：(1)广泛的肿瘤细胞质强染色被定义为阳性；(2)散在的弱阳性或巨噬细胞染色被定义为阴性。在一种实施方式中，ATRX核内表达损失的评估标准：如果肿瘤细胞核未被染成棕色，而非肿瘤细胞核、小胶质细胞、淋巴细胞和星形细胞表现为强阳性，那么定义为ATRX核内表达损失。在一种实施方式中，所述系统用于区分原发胶质母细胞瘤、WHO分级II/III胶质瘤的少突胶质细胞瘤、WHO分级II/III胶质瘤的星形细胞瘤和继发胶质母细胞瘤。在一种实施方式中，所述免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试剂盒检测ATRX蛋白氨基酸序列位点为2211-2413。除了通过免疫组化的方法外，IDH1-R132H还可通过焦磷酸测序技术(pyro-sequencing)检测实现，ATRX突变可通过外显子测序检测，其表达损失也可由转录组测序(ma-seq)来检测。这些检测方法目前都较为技术较复杂，且价格较高，普及性较差，与此对比，IDH1R132H和ATRX核内蛋白损失可通过免疫组化的方法检测，方法一致性强，技术要求不高，价格更为经济，临床实用性和普及型强，适合推广应用。本专利技术的其它方面由于本文的公开内容，对本领域的技术人员而言是显而易见的。应理解，在本专利技术范围内中，本专利技术的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合，从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅，在此不再一一赘述。下面结合具体实施例，进一步阐述本专利技术。应理解，这些实施例仅用于说明本专利技术而不用于限制本专利技术的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法，通常按照所属领域的常规条件进行。附图说明图1是IDH1-R132H蛋白在胶质瘤组织中的免疫组化染色结果图：弥散星形细胞瘤、少突星形胶质瘤和少突胶质瘤(A/B/C)表现出IDH1-R132H蛋白阳性表达；间变星形细胞瘤、间变少突星形细胞瘤和间变少突胶质瘤(D/E/F)也表现出IDH1-R132H阳性；以及原发胶质母细胞瘤和复发胶质母细胞瘤呈IDH1-R132H阴性(G/H)；继发胶质母细胞瘤呈IDH1-R132H阳性(I)。图2是ATRX核内蛋白在胶质瘤组织中的免疫组化染色结果图：弥散星形细胞瘤(WHOII，A)、间变星形细胞瘤(WHOIII，C)和继发胶质母细胞瘤(WHOIII，E)表现出明显的肿瘤细胞核内ATRX蛋白表达损失；少突胶质细胞瘤(WHOII，B)、间变少突胶质细胞瘤(WHOIII，D)和原发胶质母细胞瘤(WHOIV，F)表现出明显的肿瘤细胞核内ATRX蛋白阳性表达；和血管内皮细胞呈现阳性表达ATRX核内蛋白，可作为阳性对照。图3是IDH1-R132H和ATRX核内蛋白损失作为胶质瘤病理类型诊断的ROC评估图：使用IDH1-R132H作为判别pGBM(原发胶质母细胞瘤)和II、III级胶质瘤及sGBM(继发胶质母细胞瘤)的诊断标志物的AUC为0.7414(敏感性63.19％，特异性85.09％，A)；ATRX损失作为区分pGBM，少突胶质细胞瘤(WHO分级II/III)，和sGBM，星形细胞瘤(WHO分级II/III)诊断的生物标志物的AUC为0.8241(敏感性76.67％，特异性88.15％，图3B)；以及当联合IDH1-R132H和ATRX损失作为诊断标志物区分pGBM和少突胶质细胞瘤(WHO分级II/III)，星形细胞瘤(WHO分级II/III)、sGBM时，AUC为0.7407(敏感性53.33％，特异性94.815％，图3C)，其中诊断特异性明显高于IDH1-R132H或ATRX损失状况这两个单一标记物。具体实施方式下面结合实施例对本专利技术作进一步的详细说明。1.患者资料与标本来源总计211例胶质瘤入组本项研究，全部来自北京天坛医院胶质瘤治疗中心。所有患者于2008年1月至2015年3月接受手术切除、放疗和烷化剂治疗，术后病理诊断均为胶质瘤(依据2007年W本文档来自技高网...

【技术保护点】
基于IDH1‑R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统，其特征在于所述系统包括：(1)检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(2)检测胶质瘤患者肿瘤中IDH1‑R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书。

【技术特征摘要】
1.基于IDH1-R132H和ATRX表达的胶质瘤分型系统，其特征在
于所述系统包括：(1)检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的
试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(2)检测胶质瘤患者肿瘤
中IDH1-R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书。
2.如权利要求1所述的胶质瘤分型系统，其特征在于所述系统包
括：(1)胶质瘤患者肿瘤石蜡包埋试剂盒和任选地所述试剂盒使用说
明书；(2)免疫组化检测胶质瘤患者肿瘤中ATRX蛋白表达水平的试
剂盒和任选地所述试剂盒使用说明书；和(3)免疫组化检测胶质瘤患
者肿瘤中IDH1-R132H蛋白表达的试剂盒和任选地所述试剂盒使用说
明书。
3.如权利要求2所述的胶质瘤分型系统，其特征在于：
IDH1-R312H染色的评...

【专利技术属性】
技术研发人员：江涛，蒋传路，蔡金全，
申请(专利权)人：江涛，蒋传路，蔡金全，
类型：发明
国别省市：北京;11