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用于SCD、CRT、CRT‑D或SCA治疗识别和/或选择的方法和组合物技术

技术编号:14753134 阅读:102 留言:0更新日期:2017-03-02 10:25
本文提供适用于评定心因性猝死(SCD)、心跳骤停(SCA)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)的危险的组合物、多核苷酸、探针、试剂盒、方法、计算机系统、治疗方法和遗传标记。本发明专利技术的组合物、多核苷酸、探针、试剂盒、方法、计算机系统、治疗方法和遗传标记可基于评定一种或多种与心因性猝死(SCD)、心跳骤停(SCA)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)的存在,向可用ICD或CRT‑D治疗的那些患者提供患者选择,并且可指示用特定药物(如β‑阻滞剂)进行治疗。

【技术实现步骤摘要】
【国外来华专利技术】序列表的参考本申请包含以电子文本文件的形式提交的序列表。序列表中所含的信息在此以引用的方式并入本文中。
技术介绍
几种类型的植入式电子心脏装置可用于治疗心跳骤停(SuddenCardiacArrest,SCA)、心因性猝死(SuddenCardiacDeath,SCD)或心力衰竭(HeartFailure,HF)中的任一种:植入式心律转复除颤器(ImplantableCardioverterDefibrillator,ICD)、心脏再同步治疗(CardiacResynchronizationTherapy,CRT)起搏器或包括除颤技术的组合CRT起搏器(CRT-D)。ICD和CRT-D装置可提高存活率,因为它们对心跳骤停(SCA)或心因性猝死(SCD)风险高的患者可有效进行一级和二级预防,并且可有效终止危及生命的心室性心动过速心律失常,如心室性心博过速(ventriculartachycardia,VT)和心室颤动(ventricularfibrillation,VF)。对于许多患者来说,ICD指示各种心脏相关性疾病,包括心肌梗塞、缺血性心脏病、冠状动脉疾病、遗传性或获得性心肌病和心力衰竭。CRT和CRT-D装置有效治疗患有心力衰竭(HF)和/或左心室收缩性功能障碍(leftventricularsystolicdysfunction,LVSD)的患者,并可减少再住院,并且提高这些患者群的功能状态和生活品质。心室性心博过速(VT)、心室颤动(VF)和SCA/SCD也可通过使用药理学疗法来抑制或治疗。这些药理学疗法通常被称作抗心律失常药(anti-arrhythmicdrugs,AAD)并且基于作用机制进一步被细分(例如,I类、II类和III类)。AAD可单独使用或与ICD或CRT-D组合使用。尽管此类疗法有效用于SCA、SCD、HF或阻滞预防,但是由于缺少识别易感患者的SCD、SCA或HF风险的可靠方法,因此可受益于这些疗法的许多患者不接受指定装置或药物。已经提出左心室功能、临床共同罹病率、QRS持续时间和各种电生理检验方法作为筛选潜在心律失常死亡风险高的患者的标准。然而,风险分层仍不能令人满意,因为其主要使用单一临床标记(即左心室射血分数)来进行。这个标记不仅对于识别当前指定ICD患者是不完美的,而且它不包括在其他方面无症状的处于猝死风险的大部分人群。可受益于ICD或CRT-D但不是当前指定的许多患者可基于其遗传倾向性而被识别。观测研究表明可存在对于心因性猝死的风险的独立遗传学贡献。然而,传统的离子通道基因的探索和全基因组关联研究(genome-wideassociationstudies,GWAS)已经仅识别小部分的SCD的遗传学贡献。此外,并不存在对于单独一种或多种包括关于快速性心律失常事件的信息的诊断遗传标记或与遗传标记结合的组合的平台。存在对处于SCA、SCD或HF中的任一种的风险的患者的风险分层的遗传学根据的需要。还存在对于如本文中识别的用于识别可受益于单独ICD和CRT-D装置或与药物治疗组合的患者的遗传标记、试剂盒和方法、电子计算机方法的需要。
技术实现思路
适用于评定心因性猝死(SCD)、心跳骤停(SCA)和心力衰竭(HF)的风险的组合物、多核苷酸、探针、试剂盒、方法、计算机系统和遗传标记是本文所提供的。本专利技术的组合物、多核苷酸、探针、试剂盒、方法、计算机系统和遗传标记可基于评定一种或多种与心室性心律失常(VA)、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)的存在提供对于可用ICD或CRT-D治疗的那些患者的患者选择。在任何实施例中,可针对包含于在SEQIDNO.1-2中的核苷酸序列中的任一个中的SNP评定遗传样本。在任何实施例中,一种或多种与使用抗心律失常药(AAD)治疗处于心室性心律失常(VA)、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)的风险的患者相关的单核苷酸多态性(SNP)的系统包含具有用算法编程的计算机处理器和与编程的处理器通信的一种或多种遗传学数据库的计算机系统。在任何实施例中,编程的计算机处理器可用于针对所描述的病况或治疗中的任一个诊断患者,和/或对于在包含于获自患者和/或获自一种或多种遗传学数据库的一种或多种遗传样本中的DNA中所检测的一种或多种已知SNP推算p值。本专利技术的第一方面涉及用于用抗心律失常药(AAD)治疗患者的经分离核酸分子,其中患者患有心室性心律失常(VA)、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)。患者可具有包含于在SEQIDNO.1-2中的核苷酸序列中的任一个中的单核苷酸多态性(SNP)。经分离核酸可重叠在SEQIDNO.1-2中的任一个中的多态位置。本专利技术的第二方面涉及用于使用其中的遗传标记评定VA、SCD、SCA或HF的风险的诊断试剂盒和方法,提供具有至少一种用于评定一种或多种与VA、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)在遗传样本中的存在的探针,其中SNP包含于在SEQIDNO.1-2中的核苷酸序列中的任一种中。本专利技术的第三方面涉及用于用抗心律失常药(AAD)或生物治疗治疗患有VA、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)的患者的伴随诊断,其中SNP包含于在本专利技术所涵盖的SEQIDNO.1-2中的核苷酸序列中的任一个中。本专利技术的第四方面涉及使用诊断试剂盒和方法辨别具有对VA、SCD、SCA或HF增加的易感性的患者的方法,还提供包括各种DNA微阵列、通过单独或与其它标记组合使用遗传标记的电子计算机方法,其中至少一种探针用于评定一种或多种与VA、心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)在遗传样本中的存在,其中SNP包含于在SEQIDNO.1-2中的核苷酸序列中的任一个中。DNA微阵列可为原位合成的寡核苷酸、点样材料的随机或非随机组装的基于珠粒的阵列和机械组装阵列,其中材料可为寡核苷酸、cDNA克隆或聚合酶链反应(PCR)扩增子。具体地说,提供一种用于检测在遗传样本中一种或多种VA、SCA、SCD或HF相关的多态性的诊断试剂盒,其具有至少一种用于评定在SEQIDNO.1-2中的任一个中单核苷酸多态性(SNP)存在的探针。还提供一种用于检测在遗传样本中一种或多种SCA、SCD或HF相关的多态性的DNA微阵列,其由至少一种用于评定在SEQIDNO.1-2中的任一个中单核苷酸多态性(SNP)的存在的探针制成。本专利技术的第一方面、第二方面、第三方面和第四方面涵盖一种用于检测一种或多种与可用CRT-D或ICD治疗的VA、SCA、SCD或HF相关的单核苷酸多态性(SNP)的诊断试剂盒,其包含至少一种探针,其用于评定所述一种或多种SNP在遗传样本中的存在,SNP选自以下序列中的任一个:由本专利技术的第一方面、第二方面、第三方面和第四方面所涵盖的是包含对于主要或次要等位基因足以识别具有选自SEQIDNO.1-2中的任一个的单核苷酸多态性(SNP)的核苷酸序列的任何长度的互补序列的多核苷酸,其中互补序列的长度在约12至101个核苷酸之间,侧本文档来自技高网
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【技术保护点】
一种诊断试剂盒,其包含:至少一种探针,用于评定一种或多种与心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)在遗传样本中的存在;其中所述探针具有能够由电学、荧光或放射性装置检测的标记,其中所述SNP包含于核苷酸序列SEQ ID NO.1‑2中的任一个中,其中至少一种探针与SEQ ID NO.1‑2中的任一个中的多态位置重叠,其中所述多态位置通过单个碱基对至足以识别所述SNP或产生杂交的任何数目个碱基对侧接在5′或3′侧上,所述碱基对侧接所述多态位置的所述5′和3′侧;以及其中心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)可用具有除颤技术的组合CRT起搏器(CRT‑D)、植入式心律转复除颤器(ICD)、药理学疗法或生物学疗法来治疗。

【技术特征摘要】
【国外来华专利技术】2014.05.05 US 61/988,323;2015.01.16 US 62/104,0981.一种诊断试剂盒,其包含:至少一种探针,用于评定一种或多种与心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)中的任一种相关的单核苷酸多态性(SNP)在遗传样本中的存在;其中所述探针具有能够由电学、荧光或放射性装置检测的标记,其中所述SNP包含于核苷酸序列SEQIDNO.1-2中的任一个中,其中至少一种探针与SEQIDNO.1-2中的任一个中的多态位置重叠,其中所述多态位置通过单个碱基对至足以识别所述SNP或产生杂交的任何数目个碱基对侧接在5′或3′侧上,所述碱基对侧接所述多态位置的所述5′和3′侧;以及其中心跳骤停(SCA)、心因性猝死(SCD)、心室性心律失常(VA)或心力衰竭(HF)可用具有除颤技术的组合CRT起搏器(CRT-D)、植入式心律转复除颤器(ICD)、药理学疗法或生物学疗法来治疗。2.根据权利要求1所述的诊断试剂盒,其中所述多态位置在位置26或27处。3.根据权利要求1所述的诊断试剂盒,所述至少一种探针具有选自以下群组的长度:12至101、25至35、18至30、17至24、15至101、17至101、19至101、21至101、24至101、26至101、15至50、17至50、19至50、21至50、24至50和26至50个核苷酸。4.根据权利要求1所述的诊断试剂盒,其进一步包含聚合酶链反应(PCR)引物集用于扩增对应于SEQIDNO.1-2中的任一个的核酸片段。5.根据权利要求1到4中任一权利要求所述的诊断试剂盒,其进一步包含用软件编程的计算机处理器,所述软件用于提取所述诊断试剂盒中所述至少一种探针的杂交信息。6.根据权利要求1到4中任一权利要求所述的诊断试剂盒,其中所述至少一种探针是等位基因特异性寡聚物(ASO)。7.根据权利要求中1到4任一权利要求所述的诊断试剂盒,其中所述SNP是双等位的或多等位的。8.根据权利要求1到4中任一权利要求所述的诊断试剂盒,其中所述至少一种探针选...

【专利技术属性】
技术研发人员:奥汉·索伊肯塔拉·纳希杰弗里·兰德
申请(专利权)人:美敦力公司奥汉·索伊肯塔拉·纳希杰弗里·兰德
类型:发明
国别省市:美国;US

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