用于预测肺鳞癌患者预后的系统技术方案

本发明专利技术公开了一种用于预测肺鳞癌患者预后的系统，包括检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin五种蛋白质表达量的系统和蛋白质表达量数据处理系统。检测上述五种蛋白质表达量的系统通过免疫组织化学染色方法测定蛋白质的表达量；蛋白质表达量数据处理系统将来自待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织中所述五种蛋白质表达量转换为预后分值，根据预后分值预测待肺鳞癌患者的预后。

【技术实现步骤摘要】

本专利技术涉及生物医学领域，具体涉及用于预测肺鳞癌患者预后的系统。
技术介绍
肺癌是当今世界上癌症相关死亡中最常见的原因，而其中80％为非小细胞肺癌(NSCLC)。TNM分期是目前为人们所普遍接受的临床分期系统，被用于预测预后并指导非小细胞肺癌患者的治疗。然而，目前的TNM分期系统远不足以准确预测非小细胞肺癌患者的预后情况。比如，对于肺癌患者来说，即使处于临床Ⅰ期，肺癌的复发率也高达35-50％。另外，相当一部分患者仅靠手术方式即能治愈，这些病人应该可以避免基于当前TNM系统而进行辅助性化疗所带来的极强副反应。为了提高对非小细胞肺癌患者预后的预测效果，人们已经投入了极大努力去鉴定和识别其相关的分子标志物谱。很多研究肺癌的团队都曾报道过具有不同预后能力的基因表达谱。然而，到目前为止还没有一个基因表达谱应用于非小细胞肺癌临床预后的预测。肺鳞癌又称肺鳞状上皮细胞癌，占原发性肺癌的40％～51％，多见于中老年男性，与吸烟有密切关系。主要是由支气管黏膜柱状上皮细胞化生后形成的，包括支气管上皮细胞受慢性刺激和损伤、纤毛丧失、基底细胞鳞状化生或典型增生等。肺鳞癌以中央型肺癌多见，并有胸管腔内生长的倾向，肺鳞癌早期常引发支气管狭窄，或阻塞性肺炎。肺鳞癌的恶性程度变异较大，一般来说与其他几种肺癌相比，鳞癌生长较为缓慢，往往发现时肿瘤已经生长较大。
技术实现思路
本专利技术所要解决的技术问题是如何对肺鳞癌患者进行预后预测。为解决上述技术问题，本专利技术首先提供了用于预测肺鳞癌患者预后的系统，包括检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统可包括通过免疫组织化学染色方法测定所述五种蛋白质的表达量所需的试剂和/或仪器。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，所述用于预测肺鳞癌患者预后的系统包括包括蛋白质表达量数据处理系统，所述蛋白质表达量数据处理系统用于将来自待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织(手术切除的肺鳞癌组织)中所述五种蛋白质表达量转换为所述待预测肺鳞癌患者的预后分值，根据所述待预测肺鳞癌患者的预后分值预测所述待预测肺鳞癌患者的预后。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，所述蛋白质表达量数据处理系统内设模块1-a和模块1-b，所述模块1-a用于将来自待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织中所述五种蛋白质表达量转换为所述待预测肺鳞癌患者的预后分值，所述模块1-b用于根据所述待预测肺鳞癌患者的预后分值预测所述待预测肺鳞癌患者的预后。所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统在制备预测肺鳞癌患者预后的系统中的应用也属于本专利技术的保护范围。所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统和蛋白质表达量数据处理系统在制备预测肺鳞癌患者预后的系统中的应用也属于本专利技术的保护范围；所述蛋白质表达量数据处理系统为上述任一所述蛋白质表达量数据处理系统。上述应用中，所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统可包括通过免疫组织化学染色方法测定所述五种蛋白质的表达量所需的试剂和/或仪器。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，所述五种蛋白质均来自于人(Homosapiens)。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，所述肺鳞癌患者为经手术切除肺鳞癌组织的肺鳞癌患者。上述用于预测肺鳞癌患者预后的系统中，检测上述五种蛋白质的表达量的系统具体可为免疫组织化学染色方法测定上述五种蛋白质的表达量所需的试剂和/或仪器，如EGFR的单克隆抗体或多克隆抗体、p38α的单克隆抗体或多克隆抗体、AKT1的单克隆抗体或多克隆抗体、SOX2的单克隆抗体或多克隆抗体和E-cadherin的单克隆抗体或多克隆抗体。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了一种预测肺鳞癌患者预后的方法。本专利技术所提供的预测肺鳞癌患者预后的方法，包括：C、检测来自待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织样本的EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量；D、将所述五种蛋白质表达量转换为所述待预测肺鳞癌患者的预后分值，根据所述待预测肺鳞癌患者的预后分值预测所述待预测肺鳞癌患者的预后。上述方法中，预后分值也可以通过“组合分子标志物筛选及模型构建软件”(软件著作权登记号为2014SR142190)获得。上述方法中，所述五种蛋白质表达量可根据免疫组织化学染色方法获得。上述方法中，所述分离的肺鳞癌组织样本可来自所述待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织经过福尔马林固定石蜡包埋制备的样本或来自所述待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织的冰冻切片。上述方法中，所述五种蛋白质表达量转换为所述待预测肺鳞癌患者的预后分值的方法可包括将所述五种蛋白质表达量转化为蛋白质表达量向量，将所述蛋白质表达量向量代入公式1得到f(v)，将f(v)代入公式2，得到所述待预测肺鳞癌患者的预后分值；所述公式1为：所述公式1中，v是蛋白质表达量向量，简称向量，sv_coef(i)是支持向量的系数，SV(i)是支持向量；所述公式2为：所述公式2中，prob(v)为待预测肺鳞癌患者的预后分值。所述蛋白质表达量向量以v表示，v＝(xAKT1,xE-cadherin,xEGFR,xp38α,xSOX2)。上述方法中，根据所述待预测肺鳞癌患者的预后分值预测所述待预测肺鳞癌患者的预后可为通过受试者工作特征曲线(ROC曲线)确定诊断阈值，比较所述待预测肺鳞癌患者的预后分值和所述诊断阈值的大小，如果所述待预测肺鳞癌患者的预后分值小于或等于所述诊断阈值，所述待预测肺鳞癌患者的预后不良，如果所述待预测肺鳞癌患者的预后分值大于所述诊断阈值，所述待预测肺鳞癌患者的预后良好。预后判断也可通过“非小细胞肺癌预后判断软件”(软件著作权登记号为2014SR157070)获得。所述通过受试者工作特征曲线确定诊断阈值是以具有统计学意义数量的正常肺组织中所述五种蛋白质表达量为对照，根据具有统计学意义数量的肺鳞癌组织中所述五种蛋白质表达量和相应的肺鳞癌患者分组信息制作受试者工作特征曲线，ROC曲线上的最优值为阈值；所述分组信息是肺鳞癌患者从手术切除肺鳞癌组织开始存活的时间，3年以上(大于等于3年)为一组，不足3年(小于3年)为一组；所述最优值是在特异性最大的基础上敏感性尽可能地大。为解决上述技术问题，本专利技术还提供了D1)和/或D2)中的应用：D1)EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin五种蛋白质作为标志物在预测肺鳞癌患者预后中的应用；D2)EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin五种蛋白质作为标志物在制备预测肺鳞癌患者预后的产品中的应用。本专利技术还提供了一种产生肺鳞癌相关蛋白质特征谱的方法，包括检测来自TNMI-III期肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织样本中EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin五种蛋白质表达量的步骤。本申请中所述肺鳞癌患者可为TNMI-II本文档来自技高网...

【技术保护点】
用于预测肺鳞癌患者预后的系统，包括检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E‑cadherin这五种蛋白质表达量的系统。

【技术特征摘要】
2015.08.06 CN 201510477587X1.用于预测肺鳞癌患者预后的系统，包括检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统。2.根据权利要求1所述用于预测肺鳞癌患者预后的系统，其特征在于：所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统包括通过免疫组织化学染色方法检测所述五种蛋白质的表达量所需的试剂和/或仪器。3.根据权利要求1或2所述预测肺鳞癌患者预后的系统，其特征在于：所述用于预测肺鳞癌患者预后的系统包括蛋白质表达量数据处理系统，所述蛋白质表达量数据处理系统用于将来自待预测肺鳞癌患者的分离的肺鳞癌组织中所述五种蛋白质表达量转换为所述待预测肺鳞癌患者的预后分值，根据所述待预测肺鳞癌患者的预后分值预测所述待预测肺鳞癌患者的预后。4.权利要求1或2所述的检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统在制备预测肺鳞癌患者预后的系统中的应用。5.权利要求1或2所述的检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统和蛋白质表达量数据处理系统在制备预测肺鳞癌患者预后的系统中的应用；所述蛋白质表达量数据处理系统为权利要求3所述的蛋白质表达量数据处理系统1。6.根据权利要求4或5所述的应用，其特征在于：所述检测EGFR、p38α、AKT1、SOX2和E-cadherin这五种蛋白质表达量的系统包括通过免疫组织化学染色方法测定...

【专利技术属性】
技术研发人员：张学敏，周涛，靳宝锋，
申请(专利权)人：中国人民解放军军事医学科学院生物医学分析中心，
类型：发明
国别省市：北京;11