包含分析单元的系统和方法技术方案

技术编号:11041916 阅读:93 留言:0更新日期:2015-02-12 05:00
公开了包含分析单元的系统和方法,所述系统包括:第一处理通道;第二处理通道;第三处理通道;传送梭,所述传送梭可操作地耦接到所述第一、第二和第三处理通道;以及控制器,所述控制器可操作地耦接到所述第一、第二以及第三处理通道和所述传送梭中的每一个,所述控制器被配置成执行第一规程和第二规程,其中所述控制器在执行所述第一规程中引导所述传送梭,以将第一化验盒从所述第一处理通道移动到所述第二处理通道,并且其中所述控制器在执行所述第二规程中引导所述传送梭,以将第二化验盒从所述第一处理通道移动到所述第三处理通道,而不将所述第二化验盒移动到所述第二处理通道。

【技术实现步骤摘要】
本申请为下述申请的分案申请, 原申请的申请日(国际申请日):2011年7月22日, 原申请的申请号:201180045939.4(国际申请号:PCT/US2011/045107), 原申请的专利技术名称:。 相关申请的交叉引用 本申请要求在2010年7月23日提交的美国临时申请61/367, 343的优先权权益, 为了所有的目的而在此结合该临时申请的全部内容。
技术介绍
许多核酸序列具有临床相关性。例如,与传染性的生物体有关的核酸序列通过生 物体提供传染存在的指示。一般没有在病人样本中表达的核酸序列可以指示与疾病或者其 他症状有关的途径的激活。其他核酸序列仍然可以指示在病人对推荐疗法的可能响应中的 差异。 临床相关的核酸的判定通常取决于控制的特定核酸序列的扩增以及扩增产品的 检测。对于准备就绪的判定,扩增通过生成在样本中找到的足够的核酸副本来改进分析的 灵敏度。扩增同样可以通过仅仅选择性地生成临床感兴趣的那些核酸来改进分析特异性。 特别当扩增生成大量目标核酸序列的副本时,利用基于扩增的判定的问题是可能的事,来 自一个样本的这些副本中的一些副本可能污染其他样本,从而产生明显提升的结果,在该 明显提升的结果中,没有目标核酸序列原始地存在于样本中。 其他污染源可能影响核酸的判定。样本之间的遗留物可能促成污染材料。扩增混 合物可以从在表面上传送的或由化验员传送的或由浮质传送的环境源中接收污染材料。在 一些情况下,无意识的试剂传送,诸如不合适的扩增引物,可能污染混合物并导致错误的结 果。扩增混合物同样可以通过目标核酸的不完全净化而保留原始存在于样本中的干扰物 质。因此,需要避免来自各种来源的污染材料的传送和保留的核酸分析的自动化。 临床实验室工作流程是医疗护理运送的结果并在公共机制之间变化。门诊或者大 的联合医疗可以在一天中以相对恒定的速率生成病人试样。与此相反,临床参考实验室可 以在一到两个运送中接收它所有的试样,并且大医院可以在全天通过早晨抽入的由不规则 的样本流补充的大量血液生成试样。大多数核酸分析试样以与请求化验的类型无关的序列 到达临床实验室。在一些情况下,选择的试样可以是具有取决于结果的直接或者关键性的 治疗决定的高优先级。其他试样可以是更日常的优先级。根据个别的实验室实践,诸如实 验室控制的非试样样本可能被散布在临床试样中。在一些情况下,试剂的耗尽或者特别多 的试剂的耗尽可以支配控制和校准样本的插入,而不管队列中的其他样本。 因此,需要具有灵活的和可调整的操作能力以便匹配临床实验室的不可预知的需 求的分析系统。 核酸分析使用试样类型的混合来判定来自各种源生物体的多个分析物。这些输入 驱动各种处理要求。例如,RNA和DNA具有不同的化学性质和稳定性;它们的制备可以使用 不同的处理摄生法、不同的酵素以及不同的热条件。碱基序列和目标分析物的长度两者影 响结合能,并且由此影响处理。用于扩增的互补的低聚核苷酸的长度和序列进一步影响扩 增条件。 分析目标的不同的源生物体可以要求不同的步骤来释放或者分离核酸序列。例 如,从革兰氏阳性细菌中释放DNA序列可能使用提升的温度,该提升的温度不用于从相对 不稳定的白血球中释放的DNA序列。 因此,需要能够自由地混杂多种处理规程的分析系统,每个处理规程由多种处理 步骤组成。存在试图致力于以上描述的一些问题的技术。 Russel/Higuchi在US5994056,HomogeneousMethodsforNucleicAcid AmplificationandDetection(用于核酸扩增和检测的均勻方法)中描述了用于使用诸如 聚合酶链反应(PCR)方法的核酸检测的改进方法。Higuchi描述了用于同时扩增和检测以 提高在先方法的速度和精确度的方法。该方法提供在扩增反应期间用于监视产物DNA的增 加的手段。根据说明书,在启动扩增反应时没有打开反应容器的情况下,以及在该反应之后 没有任何附加操控或者操纵步骤的情况下,检测扩增的核酸。 K. Rudi等人在 1997 年 3 月的BioTechniques22(3)的第 506-511 页中描述了 Rapid, Universal Method to Isolate PCR-Ready DNA Using Magnetic Beads(使用磁性 珠来分离PCR就绪的DNA的快速通用方法)。Rudi等人描述了将用于快速DNA分离的基于 磁性珠的装备(Dynabeads?DNA DIRECT? ;Dynal A.S.)应用到各种生物体和组织,以便产 生用于PCR就绪的DNA的净化的常规途径。在30分钟以内制备适合于PCR的DNA。 使核酸分析自动化的系统具有悠久的历史。集成平台示范了自动化分析和制备步 骤的全部范围,包括核酸分离,分离材料的扩增以及扩增产物的检测。 例如,Bienhaus等人在US5746978,DeviceforTreatingNucleicAcidsfrom aSample(用于处理来自样本的核酸的装置)中描述了使从其他样本成分中分离核酸的处 理步骤与用于核酸扩增的步骤链接的单个装置。该装置包含用于个别的处理步骤的反应 室,一个室的出口附接于另一室的进口。传统的吸液仪器把容纳核酸的样本液体以及来自 样本和试剂存储器皿的所有可能必需的试剂两者传送到该装置中。Bienhaus等人描述了在 使用ES分析器(由BoehringerMannheim制造)测量的检测反应中的磁性分离、通过PCR 或者NASBA的扩增、以及使用混杂探针对PCR扩增的互补。 P.Belgrader等人在 1995 年的BioTechniques19 (3)的第 427-432 页中描述了 AutomatedDNAPurificationandAmplificationfromBlood-StainedCardsUsinga RoboticWorkstation(使用机器人工作台的来自染血卡片的自动化的DNA净化和扩增)。 Belgrader等人介绍了可以进行耦合的DNA净化和扩增的原型,一旦启动处理,就不需要用 户参与。将该方法实施到使用苯酚和异丙醇的Biomekft1000机器人工作台(Beckman仪器) 的高处理量自动化系统中,以便净化染血卡片上的DNA。Biomckft 1000使用HCU(ffi0mek? 板上的加热器冷却器单元)作为热循环器来进行DNA净化和扩增。Belgrader等人描述了 下一个目标是集成完全自动化DNA类型系统的检测步骤。 Patrick Merel等人在 1996 年Clinical Chemistry42,第 8 卷,第 1285-6 页中描 述了Completely Automated Extraction of DNA from Whole Blood(来自全血的DNA的 完全自动化的提取)。Merel等人公开了组合使用Bbmek' 2000 (Beckman仪器)以及DNA DIRECT?(Dynal法国S.A.),以便使用磁性颗粒分离来使DNA提取程序全自动化。Merel等 人使用几个不同的PCR规程来评估获得DNA的数量本文档来自技高网...

【技术保护点】
一种用于判定样本中的核酸的存在的系统,其特征在于,所述系统包括:第一处理通道;第二处理通道;第三处理通道;传送梭,所述传送梭可操作地耦接到所述第一、第二和第三处理通道;以及控制器,所述控制器可操作地耦接到所述第一、第二以及第三处理通道和所述传送梭中的每一个,所述控制器被配置成执行第一规程和第二规程,其中所述控制器在执行所述第一规程中引导所述传送梭,以将第一化验盒从所述第一处理通道移动到所述第二处理通道,并且其中所述控制器在执行所述第二规程中引导所述传送梭,以将第二化验盒从所述第一处理通道移动到所述第三处理通道,而不将所述第二化验盒移动到所述第二处理通道。

【技术特征摘要】
2010.07.23 US 61/367,3431. 一种用于判定样本中的核酸的存在的系统,其特征在于,所述系统包括: 第一处理通道; 第二处理通道; 第H处理通道; 传送梭,所述传送梭可操作地禪接到所述第一、第二和第H处理通道;W及 控制器,所述控制器可操作地禪接到所述第一、第二W及第H处理通道和所述传送梭 中的每一个,所述控制器被配置成执行第一规程和第二规程,其中所述控制器在执行所述 第一规程中引导所述传送梭,W将第一化验盒从所述第一处理通道移动到所述第二处理通 道,并且其中所述控制器在执行所述第二规程中引导所述传送梭,W将第二化验盒从所述 第一处理通道移动到所述第H处理通道,而不将所述第二化验盒移动到所述第二处理通 道。2. 如权利要求1所述的系统,其特征在于,其中所述第一、第二和第H处理通道彼此平 行,并且同样正交于所述传送梭的取向。3. 如权利要求1所述的系统,其特征在于,其中所述第一处理通道包括盒装载通道,并 且所述第二处理通道是加热通道,W及所述第H处理通道是冲洗通道。4. 如权利要求1所述的系统,其特征在于,从群中选择所述第一、第二和第H处理通 道,所述群由被配置成加温化验盒的加热通道、扩增制备通道、被配置成维持化验盒的温度 的温度稳定加热通道、洗脱通道和冲洗通道组成。5. 如权利要求1所述的系统,其特征在于,其中所述第一化验盒用于DNA分析,W及所 述第二化验盒用于RNA分析。6. 如权利要求1所述的系统,其特征在于,包括: 用于处理样本的制备场所; 分析场所,用于使所述反应容器中包含的所述处理样本特性化; 输送装置,所述输送装置被配置成在所述制备场所和所述分析场所之间传送所述反应 容器; 其中所述制备场所、所述分析场所和所述输送装置被禪接到所述控制器。7. 如权利要求6所述的系统,其特征在于,其中所述制备场所和所述分析场所在外壳 内被彼此邻近安置。8. 如权利要求6所述的系统,其特征在于,其中所述分析场所包括分析单元,所述分析 单元是热循环器模块。9. 如权利要求1所述的系统,其特征在于, 其中所述控制器被配置成执行第H规程,所述第H规程引导所述传送梭,W将第H化 验盒移动到所述第一处理通道中,在固定间隔之后,引导所述传送梭,W将所述第H化验盒 移动到所述第一处理通道之外,并且在所述固定间隔内,引导所述第一处理通道,W执行操 作的第H序列,W及 其中所述控制器还被配置成执行第四规程,所述第四规程引导所述传送梭,W将第四 化验盒移动到所述第一处理通道中,在所述固定间隔之后,引导所述传送梭,W将所述第四 化验盒移动到所述第一处理通...

【专利技术属性】
技术研发人员:布赖恩·D·威尔逊萨米·D·艾拉路里大卫·L·安德森马太·S·大卫马太·D·埃里克森罗伯特·B·格温艾伦·N·约翰逊查尔斯·S·克赖汗泽尔盖瑞克·A·莫勒迈克尔·J·罗斯马克·F·赛尔布格丹尼尔·R·舒密特里德·B·瓦格纳约书亚·D·威尔斯托马斯·M·斯塔奇莱克大卫·L·杨
申请(专利权)人:贝克曼考尔特公司
类型:发明
国别省市:美国;US

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